More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2376 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 353 aa  694    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0997  hypothetical protein  35.42 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0549  hypothetical protein  31.56 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 		 370 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  30.85 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 394 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  47.52 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3089  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  45.78 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3568  glycosyl transferase group 1  40.85 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  43.48 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  44.05 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  55.56 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  51.56 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  42.17 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  38.17 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  32.22 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  40.23 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  43.75 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  44.87 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  42.53 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  43.84 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  43.66 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  47.89 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  39.77 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1182  putative glycosyl transferase  50.82 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.202119  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  39.56 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  49.3 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  41.59 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  40.74 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  44.62 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  42.17 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  44.94 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  42.31 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  38.39 
 
 		 404 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.44 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 385 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  44.44 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.14 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.45 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.45 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.45 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.23 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.45 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.45 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.45 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  47.14 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  46.27 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.45 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.17 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 		 762 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  45.71 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  27.86 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  47.62 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  43.66 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  45.78 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  52.83 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  46.88 
 
 		 704 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  44.93 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  48.53 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  29.86 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  41.1 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.76 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  57.69 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4248  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  38.53 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 		 426 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>