More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2994 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  96.2 
 
 
368 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
368 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
370 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
373 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
394 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
373 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
368 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
353 aa  99.4  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  32.93 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0997  hypothetical protein  31.8 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  33.66 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
467 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 
426 aa  62.8  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  29.69 
 
 
364 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 
388 aa  59.7  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
387 aa  59.7  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  31.79 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  25.11 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
440 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  45.71 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
398 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
421 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  44.29 
 
 
392 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  37.76 
 
 
379 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
432 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
406 aa  56.2  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  38.53 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  39.36 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  38.53 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 
422 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  35.64 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  35.64 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  35.64 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  40.7 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  25.09 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
385 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
410 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.44 
 
 
388 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
409 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
385 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  43.06 
 
 
371 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
420 aa  53.5  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
420 aa  53.5  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
403 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
389 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4248  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
356 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  23.87 
 
 
371 aa  53.1  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  38.33 
 
 
346 aa  53.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
374 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3347  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  21.9 
 
 
359 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  34.65 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  34.65 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  34.65 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
417 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
400 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 
353 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  43.06 
 
 
371 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
434 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
402 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
424 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.23 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
414 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>