More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3568 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3568  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3089  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
352 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  40.85 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  40.2 
 
 
423 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  31.29 
 
 
355 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
402 aa  62  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  42.05 
 
 
393 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
368 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
339 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
402 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
370 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  38.46 
 
 
366 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 
366 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 
374 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
405 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
414 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
408 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  40.23 
 
 
368 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
360 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  43.3 
 
 
410 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 
381 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
428 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
366 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  45.95 
 
 
358 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
389 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.73 
 
 
396 aa  55.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
381 aa  55.1  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
422 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  47.06 
 
 
422 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
422 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  38.96 
 
 
420 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  38.96 
 
 
420 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
406 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  42.16 
 
 
433 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 
371 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
380 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
373 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
373 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
364 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  40.95 
 
 
411 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  42.55 
 
 
395 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
410 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
371 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
371 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  39.77 
 
 
398 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
417 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
393 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 
416 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  37.38 
 
 
413 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
394 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 
374 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  35.61 
 
 
381 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  37.38 
 
 
413 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  37.89 
 
 
371 aa  52.4  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 
372 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  39.58 
 
 
770 aa  52.4  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
381 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
344 aa  52  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
393 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  42.05 
 
 
425 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 
388 aa  51.6  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
385 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  41.79 
 
 
372 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  30.73 
 
 
378 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  40.26 
 
 
414 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 
381 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.62 
 
 
374 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
401 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
376 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
401 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
404 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 
387 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
426 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
415 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.76 
 
 
378 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
378 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  34.85 
 
 
381 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
405 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  31.25 
 
 
378 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  34.85 
 
 
381 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
384 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  42.5 
 
 
402 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
387 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
385 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
382 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  42.55 
 
 
386 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
373 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  31.25 
 
 
378 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
378 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
378 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
378 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
415 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3205  glycosyl transferase, group 1  41.94 
 
 
381 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  41.57 
 
 
425 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
371 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
378 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
466 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  50.82 
 
 
418 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
427 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>