More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0456 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 394 aa  803    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  79.37 
 
 		 373 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  61.65 
 
 		 368 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 370 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  26.88 
 
 		 368 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0997  hypothetical protein  28.94 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.53 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  40.23 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  32.09 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  21.53 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  25.9 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  35.44 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  20.83 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.62 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  30.43 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  33.67 
 
 		 803 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  39.08 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  28.17 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  38.2 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  39.08 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  36.84 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1001  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  37.19 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 424 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.69 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 364 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  39.56 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  20.89 
 
 		 383 aa  53.5  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0549  hypothetical protein  24.29 
 
 		 336 aa  53.5  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 404 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  41.79 
 
 		 557 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3783  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653155  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  35.53 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  27.63 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4248  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  41.46 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.17 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  39.08 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0147  helix-turn-helix, AraC type  24.64 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.586642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  35 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  25.48 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>