179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0740 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
393 aa  799    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  41.71 
 
 
382 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  41.37 
 
 
379 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  37.61 
 
 
378 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2479  hypothetical protein  41.96 
 
 
379 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0912  putative glycosyltransferase group 1 protein  41.96 
 
 
379 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2617  hypothetical protein  41.96 
 
 
379 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675029  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  38.76 
 
 
378 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  38.46 
 
 
378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  38.26 
 
 
392 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  36.54 
 
 
390 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  38.17 
 
 
381 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  38.17 
 
 
381 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  38.48 
 
 
396 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  37.87 
 
 
381 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0549  hypothetical protein  41.91 
 
 
379 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  31.18 
 
 
364 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
358 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
384 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4248  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 
356 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1957  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
351 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.181444  normal  0.44965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  32.7 
 
 
368 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 
467 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  30.28 
 
 
503 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
375 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
453 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
373 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 
349 aa  51.6  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
871 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30 
 
 
423 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
458 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
347 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
370 aa  50.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
768 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
366 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
433 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  33.01 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  26.02 
 
 
432 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.52 
 
 
2401 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  19.82 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1402  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  40.45 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  33.72 
 
 
343 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
431 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  23.85 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  34.58 
 
 
344 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
368 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.93 
 
 
379 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 
457 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
639 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
367 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 
347 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
414 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
426 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
413 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
390 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
369 aa  47  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0730  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00119132  hitchhiker  0.00102221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
816 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
538 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13720  glycosyltransferase  36.94 
 
 
351 aa  46.6  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  31.68 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  36.64 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.75 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
517 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>