73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3826 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  99.74 
 
 
381 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  93.62 
 
 
378 aa  666    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
381 aa  775    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  93.35 
 
 
378 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  100 
 
 
381 aa  775    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  92.55 
 
 
378 aa  690    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  86.21 
 
 
379 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2479  hypothetical protein  75.92 
 
 
379 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2617  hypothetical protein  76.2 
 
 
379 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0912  putative glycosyltransferase group 1 protein  76.2 
 
 
379 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0549  hypothetical protein  73.67 
 
 
379 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  66.57 
 
 
392 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  65.57 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  66.85 
 
 
396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 
393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  39.34 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  33.64 
 
 
364 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
358 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
384 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  39.09 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  34.91 
 
 
368 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  39 
 
 
871 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0564  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
339 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.78 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
394 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
387 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
353 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
375 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
358 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
368 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
405 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
373 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
360 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.8 
 
 
405 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  36.92 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  25.49 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  36.92 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  39.73 
 
 
423 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
803 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  41.1 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3568  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
232 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  39.19 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  40.23 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  39.19 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 
433 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
413 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  39.08 
 
 
768 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
425 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  40.45 
 
 
420 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
440 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
366 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
816 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
397 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  30.17 
 
 
378 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25 
 
 
401 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>