57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1721 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1721  glycosyltransferase  100 
 
 
364 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  0.18476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2270  glycosyltransferase-like protein  32.72 
 
 
378 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0740  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575105  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4913  glycosyltransferase-like protein  35.49 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.937309  hitchhiker  0.000826652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3826  glycosyltransferase-like protein  33.64 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4537  glycosyltransferase-like  33.64 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3698  glycosyltransferase-like protein  33.64 
 
 
381 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2617  hypothetical protein  36.36 
 
 
379 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675029  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2479  hypothetical protein  36.36 
 
 
379 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1063  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  33.79 
 
 
390 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.699119 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0912  putative glycosyltransferase group 1 protein  36.36 
 
 
379 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3729  glycosyltransferase-like protein  33.84 
 
 
378 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5552  glycosyltransferase-like protein  33.84 
 
 
378 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823545  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0549  hypothetical protein  37.41 
 
 
379 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3543  putative glycosyl transferase  30.7 
 
 
382 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1961  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like protein  31.4 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2240  putative glycosyltransferase group 1, RfaG-like  30.4 
 
 
396 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00876086  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
368 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  30.34 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
812 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
370 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
339 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
820 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0549  hypothetical protein  25.49 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
373 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  32.08 
 
 
355 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
373 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.33 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
337 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
372 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
373 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
394 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
362 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
367 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
424 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
353 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  32.94 
 
 
384 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  29.69 
 
 
403 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
403 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
819 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 
381 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>