More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2061 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2061  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4353  hypothetical protein  31.15 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0875589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2301  hypothetical protein  30.04 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.100288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  28.22 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  29.55 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  27.11 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  27.08 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3266  hypothetical protein  23.15 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000301763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  26.55 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  25.17 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  27.7 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  25.98 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  25.83 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  25.17 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  22.22 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  26.3 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2312  hypothetical protein  27.85 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  26.57 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  28.78 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  28.06 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03750  extra-cytoplasmic solute receptor, Bug family  27.06 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.549978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  25.25 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0711  hypothetical protein  28.05 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.926486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  25.08 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  28.32 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  26.46 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  28.14 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  25.85 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2972  hypothetical protein  24 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  26.99 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  26.03 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  26.28 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3300  hypothetical protein  25.99 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.659933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  25.63 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1077  hypothetical protein  25.52 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  24.28 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5248  extra-cytoplasmic solute receptor  24.13 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821441  normal  0.224057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  26.76 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  24.52 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  24.57 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  26.09 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  28.4 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  23.7 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  26.35 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  28.09 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6308  hypothetical protein  26.28 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  27.97 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  23.81 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  27.36 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  23.87 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  26.6 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  26.94 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  29.06 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  25.61 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  27.62 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  24.84 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3920  extra-cytoplasmic solute receptor  27.43 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00653883  normal  0.672719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4640  hypothetical protein  25.74 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  23.16 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  25.07 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2932  hypothetical protein  22.58 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  26.59 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  26.4 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  25.37 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  26.62 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  26.59 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3705  hypothetical protein  26.94 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0911  hypothetical protein  27.18 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  25.89 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  27.54 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  24.58 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  25.76 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  24.66 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  27.17 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  24.74 
 
 		 698 aa  69.3  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  27.72 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  23.91 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  24.58 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  26.77 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  23.94 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  25.25 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  23.67 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  26.47 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  25.89 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2501  hypothetical protein  24.66 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  25.33 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  27.04 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  29.31 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  24.68 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  23.55 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  25.18 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  23.97 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  27.34 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  24.67 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  24.55 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  27.39 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2841  hypothetical protein  25.44 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.013507  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2769  hypothetical protein  24.91 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>