More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2972 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2972  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  38.13 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  33.96 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  33.88 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  37.42 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  34.88 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  36.96 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  35.02 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  33.66 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  37.37 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  37.37 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  33.67 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.76 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  32.9 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  35.86 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.58 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  34.1 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  34.55 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  37.37 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  34.27 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  35.49 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  36.18 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  37.91 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  35 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  36.09 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  32.92 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  32.03 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  34.65 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  35.47 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.09 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.97 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  35.02 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  33.54 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  38.91 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  35.79 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  34.98 
 
 		 336 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.47 
 
 		 333 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  32.25 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  37.36 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  35.51 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  33.89 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  31.25 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  33.02 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.23 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  33.02 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  32.55 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  36.16 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  33.55 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  33.22 
 
 		 355 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  31.87 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  36.09 
 
 		 325 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  34.14 
 
 		 327 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  35.93 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  36.47 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  35.93 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  34.1 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  34.31 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  34.84 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  34.81 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.09 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  34.19 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.24 
 
 		 328 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  32.37 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  34.95 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  34.98 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  32.33 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.05 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  32.13 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  34.23 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  34.35 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  33.64 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  33.22 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  39.69 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  32.13 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  34.01 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.11 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  35.19 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  35.56 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  32.41 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  32.68 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  33.45 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  39.18 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  35.76 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  33.67 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  34.04 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  33.87 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  35.69 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  34.44 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  32.48 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  35.85 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  34.11 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  37.91 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  33.91 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5776  hypothetical protein  34.11 
 
 		 329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  36.67 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  35.97 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>