More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4551 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  67.53 
 
 		 698 aa  942    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  91.34 
 
 		 707 aa  1235    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  100 
 
 		 684 aa  1377    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0299  hypothetical protein  60.6 
 
 		 375 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2873  protein of unknown function DUF453  55.27 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2893  hypothetical protein  55.27 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.210089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0792  hypothetical protein  55.27 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0796  hypothetical protein  55.27 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.872175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0823  hypothetical protein  55.27 
 
 		 350 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0873  hypothetical protein  54.99 
 
 		 350 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  54.6 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2588  hypothetical protein  54.99 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  55.37 
 
 		 341 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3577  hypothetical protein  52.09 
 
 		 359 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353102  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  54.49 
 
 		 341 aa  356  7.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1269  hypothetical protein  54.49 
 
 		 361 aa  353  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3163  hypothetical protein  54.34 
 
 		 359 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  49.29 
 
 		 353 aa  351  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  54.78 
 
 		 359 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  57.14 
 
 		 337 aa  350  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2055  hypothetical protein  54.47 
 
 		 359 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3685  hypothetical protein  52.57 
 
 		 370 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1879  hypothetical protein  43.82 
 
 		 357 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0988  hypothetical protein  48.47 
 
 		 387 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.375128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5177  protein of unknown function DUF453  48.19 
 
 		 372 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.841395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0878  hypothetical protein  48.47 
 
 		 372 aa  323  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  46.81 
 
 		 370 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03236  FldA  48.16 
 
 		 351 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2033  hypothetical protein  45.83 
 
 		 389 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3706  hypothetical protein  47.86 
 
 		 382 aa  309  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0396378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  44.96 
 
 		 363 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3209  hypothetical protein  45.6 
 
 		 369 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3889  hypothetical protein  46.93 
 
 		 365 aa  303  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2818  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  45.01 
 
 		 352 aa  297  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0174979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  47.01 
 
 		 370 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  44.57 
 
 		 362 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4451  hypothetical protein  44.38 
 
 		 388 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  45.18 
 
 		 363 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  45.87 
 
 		 361 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  45.87 
 
 		 361 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  43.77 
 
 		 360 aa  287  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  44.21 
 
 		 395 aa  286  9e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4025  protein of unknown function DUF453  43.41 
 
 		 367 aa  280  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  0.0966594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.85 
 
 		 326 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.73 
 
 		 356 aa  253  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.62 
 
 		 344 aa  250  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.29 
 
 		 339 aa  249  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.16 
 
 		 356 aa  249  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  249  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.88 
 
 		 330 aa  248  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.62 
 
 		 327 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.85 
 
 		 328 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.54 
 
 		 339 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.58 
 
 		 331 aa  244  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.19 
 
 		 324 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.52 
 
 		 358 aa  242  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.47 
 
 		 328 aa  242  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  40.6 
 
 		 323 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.75 
 
 		 349 aa  241  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.21 
 
 		 345 aa  241  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.21 
 
 		 345 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.26 
 
 		 331 aa  240  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.09 
 
 		 328 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  37.42 
 
 		 312 aa  239  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  40.13 
 
 		 330 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.6 
 
 		 331 aa  239  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.38 
 
 		 334 aa  238  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.33 
 
 		 310 aa  238  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.24 
 
 		 323 aa  237  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 		 328 aa  237  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.28 
 
 		 325 aa  236  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.68 
 
 		 337 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.2 
 
 		 329 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.81 
 
 		 324 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  43.05 
 
 		 332 aa  234  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.28 
 
 		 327 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.64 
 
 		 333 aa  233  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.19 
 
 		 335 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  43.39 
 
 		 325 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.28 
 
 		 328 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.59 
 
 		 348 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.43 
 
 		 335 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.86 
 
 		 330 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.6 
 
 		 328 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  231  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  43.48 
 
 		 326 aa  231  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.28 
 
 		 330 aa  231  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.28 
 
 		 330 aa  231  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  41.08 
 
 		 328 aa  230  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.87 
 
 		 327 aa  230  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.95 
 
 		 339 aa  230  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.8 
 
 		 339 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  41.53 
 
 		 330 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  39.6 
 
 		 325 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  38.72 
 
 		 395 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  40.96 
 
 		 327 aa  229  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.02 
 
 		 314 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>