123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0163 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  100 
 
 		 394 aa  801    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  55.56 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  57.7 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1269  hypothetical protein  56.82 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3163  hypothetical protein  55.62 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  56.98 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2055  hypothetical protein  57.98 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3685  hypothetical protein  57.26 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  54.6 
 
 		 684 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  54.87 
 
 		 707 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0792  hypothetical protein  52.38 
 
 		 350 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533425  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2873  protein of unknown function DUF453  52.1 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0873  hypothetical protein  52.1 
 
 		 350 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3577  hypothetical protein  52.25 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353102  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0823  hypothetical protein  52.1 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0796  hypothetical protein  52.1 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.872175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2893  hypothetical protein  52.1 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.210089 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2588  hypothetical protein  51.82 
 
 		 350 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0299  hypothetical protein  51.86 
 
 		 375 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  49.58 
 
 		 370 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  45 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0988  hypothetical protein  46.48 
 
 		 387 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.375128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5177  protein of unknown function DUF453  47.04 
 
 		 372 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.841395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1879  hypothetical protein  41.34 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  47.03 
 
 		 370 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0878  hypothetical protein  46.48 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  47.03 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  46.74 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  46.01 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  44.01 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  46.63 
 
 		 363 aa  299  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2033  hypothetical protein  44.24 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3889  hypothetical protein  44.69 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3209  hypothetical protein  45.18 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03236  FldA  45.56 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4451  hypothetical protein  42.7 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3706  hypothetical protein  43.54 
 
 		 382 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0396378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  43.49 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2818  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  43.42 
 
 		 352 aa  275  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0174979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4025  protein of unknown function DUF453  41.42 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  0.0966594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  39.32 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  37.17 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  38.58 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  38.83 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  40.33 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  37.63 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.91 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  35.42 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  36.55 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.42 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.51 
 
 		 410 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  36.06 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4311  protein of unknown function DUF453  34.82 
 
 		 381 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  35.31 
 
 		 396 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  35.31 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  35.05 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.05 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  34.85 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.7 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  35.66 
 
 		 391 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  34.19 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1938  AcnD-accessory protein PrpF  34.96 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2337  hypothetical protein  34.7 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  hitchhiker  0.0000401834 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  33.93 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  33.93 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.7 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  33.93 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  33.93 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  33.93 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  33.93 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  34.96 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3433  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.45 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0190696  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  34.37 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  34.45 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  33.42 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  33.93 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  34.7 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  34.7 
 
 		 396 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.5 
 
 		 400 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  34.5 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  34.02 
 
 		 395 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  34.02 
 
 		 395 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  34.53 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.59 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  34.11 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  33.25 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  31.82 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  32.16 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.42 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  31.99 
 
 		 397 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0582  hypothetical protein  35.31 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  32.17 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3632  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  31.82 
 
 		 397 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0535  AcnD-accessory protein PrpF  34.79 
 
 		 398 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0955  putative AcnD-accessory protein PrpF  33.77 
 
 		 400 aa  172  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3339  protein of unknown function DUF453  33.86 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1667  PrpF, AcnD-accessory  33.77 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.870319  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  32.17 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  32.47 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4143  putative AcnD-accessory protein PrpF  31.51 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>