123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2033 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2033  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  784    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5177  protein of unknown function DUF453  76.76 
 
 		 372 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.841395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0878  hypothetical protein  76.76 
 
 		 372 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0988  hypothetical protein  77.03 
 
 		 387 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.375128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4451  hypothetical protein  74.53 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3209  hypothetical protein  67.02 
 
 		 369 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  63.8 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3706  hypothetical protein  63.27 
 
 		 382 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0396378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  54.69 
 
 		 370 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  54.84 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  52.94 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  51.89 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  51.08 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  50 
 
 		 363 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  50.81 
 
 		 361 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4025  protein of unknown function DUF453  52.53 
 
 		 367 aa  355  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  0.0966594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3889  hypothetical protein  51.48 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2818  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  52.04 
 
 		 352 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0174979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  50.56 
 
 		 362 aa  343  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03236  FldA  51.11 
 
 		 351 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  47.28 
 
 		 707 aa  315  8e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  45.83 
 
 		 684 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1269  hypothetical protein  47.24 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  47.93 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0792  hypothetical protein  43.25 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533425  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2873  protein of unknown function DUF453  43.25 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200218  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0796  hypothetical protein  43.25 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.872175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2893  hypothetical protein  43.25 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.210089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0873  hypothetical protein  43.25 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  45.26 
 
 		 698 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0823  hypothetical protein  43.53 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2588  hypothetical protein  42.98 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3577  hypothetical protein  45.48 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353102  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  43.96 
 
 		 353 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3163  hypothetical protein  46.01 
 
 		 359 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  44.24 
 
 		 394 aa  299  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2055  hypothetical protein  46.83 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3685  hypothetical protein  46.83 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0299  hypothetical protein  44.86 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1879  hypothetical protein  36.14 
 
 		 357 aa  270  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  36.53 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  35.16 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  38.28 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  37.22 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  36.75 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.02 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  34.29 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3586  AcnD-accessory protein PrpF  35.01 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716521  normal  0.0110603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  36.96 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.44 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.89 
 
 		 400 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03373  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.02 
 
 		 409 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  37.16 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3433  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.95 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0190696  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  34 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  33.92 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  33.42 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  34.61 
 
 		 396 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2337  hypothetical protein  34.78 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  hitchhiker  0.0000401834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  34.62 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1938  AcnD-accessory protein PrpF  35.03 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2496  AcnD-accessory protein PrpF  33.85 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.945381  hitchhiker  0.00398819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2114  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.29 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  34.62 
 
 		 395 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  35.64 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.53 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  35.2 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02726  probable AcnD-accessory protein PrpF  36.01 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  34.78 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.94 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.53 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.94 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  34.53 
 
 		 396 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  34.44 
 
 		 391 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.53 
 
 		 396 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1767  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.01 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  34.86 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.43 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  34.27 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  33.75 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  32.65 
 
 		 397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.25 
 
 		 397 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  33.84 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  33.84 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  33.93 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  33.93 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1860  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.27 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.02 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  33.93 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  33.93 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  33.93 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  33.93 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  33.93 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  32.99 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  34.02 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6079  AcnD-accessory protein PrpF  33.33 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2319  putative AcnD-accessory protein PrpF  32.91 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1422  putative AcnD-accessory protein PrpF  33.42 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  33.67 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1667  PrpF, AcnD-accessory  34.85 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.870319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>