122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1867 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2337  hypothetical protein  85.1 
 
 
396 aa  667    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  hitchhiker  0.0000401834 
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  88.07 
 
 
396 aa  678    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  82.47 
 
 
397 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  84.69 
 
 
396 aa  656    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  793    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  84.69 
 
 
396 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  88.41 
 
 
397 aa  691    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  100 
 
 
396 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1767  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  85.1 
 
 
403 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163027  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  90.15 
 
 
396 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  96.97 
 
 
436 aa  748    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  88.78 
 
 
395 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  88.83 
 
 
395 aa  683    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1584  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  86.4 
 
 
397 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00480301  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  89.65 
 
 
396 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3632  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  82.99 
 
 
397 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  83.51 
 
 
397 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  89.65 
 
 
396 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  89.65 
 
 
396 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  82.22 
 
 
397 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  793    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  100 
 
 
396 aa  793    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  99.75 
 
 
396 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3433  putative AcnD-accessory protein PrpF  84.6 
 
 
396 aa  663    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0190696  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  88.83 
 
 
395 aa  683    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6079  AcnD-accessory protein PrpF  87.76 
 
 
395 aa  685    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  87.47 
 
 
391 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  84.63 
 
 
397 aa  650    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  90.91 
 
 
396 aa  707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1938  AcnD-accessory protein PrpF  84.85 
 
 
396 aa  667    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000190692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  84.09 
 
 
396 aa  658    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  89.65 
 
 
396 aa  704    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  89.39 
 
 
396 aa  698    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2602  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  81.57 
 
 
392 aa  628  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000005222  hitchhiker  0.0000122233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  78.79 
 
 
392 aa  628  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  80.93 
 
 
397 aa  628  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  75.25 
 
 
410 aa  621  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  78.55 
 
 
407 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  78.59 
 
 
395 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4024  putative AcnD-accessory protein PrpF  78.55 
 
 
407 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3586  AcnD-accessory protein PrpF  79.8 
 
 
398 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716521  normal  0.0110603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  78.05 
 
 
407 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  78.34 
 
 
395 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4143  putative AcnD-accessory protein PrpF  78.3 
 
 
407 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02726  probable AcnD-accessory protein PrpF  81.79 
 
 
386 aa  610  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1667  PrpF, AcnD-accessory  78.35 
 
 
398 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.870319  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  75.13 
 
 
398 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  74.68 
 
 
395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  77.16 
 
 
392 aa  594  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1860  putative AcnD-accessory protein PrpF  79.34 
 
 
389 aa  593  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2114  putative AcnD-accessory protein PrpF  75.63 
 
 
405 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2496  AcnD-accessory protein PrpF  76.52 
 
 
405 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.945381  hitchhiker  0.00398819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3297  hypothetical protein  77.86 
 
 
396 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0955  putative AcnD-accessory protein PrpF  76.09 
 
 
400 aa  587  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  74.16 
 
 
389 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2319  putative AcnD-accessory protein PrpF  75.19 
 
 
426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03373  putative AcnD-accessory protein PrpF  74.62 
 
 
409 aa  580  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1422  putative AcnD-accessory protein PrpF  73.38 
 
 
409 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1866  putative AcnD-accessory protein PrpF  71.28 
 
 
397 aa  570  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.477941  normal  0.214454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  78.48 
 
 
400 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  78.23 
 
 
400 aa  567  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0582  hypothetical protein  70.63 
 
 
398 aa  557  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0535  AcnD-accessory protein PrpF  70.38 
 
 
398 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2819  AcnD-accessory protein PrpF  71.79 
 
 
397 aa  553  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0822115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4788  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  72.75 
 
 
398 aa  553  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.343544  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1115  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  60.89 
 
 
413 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.712247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1306  PrpF, AcnD-accessory  59.9 
 
 
413 aa  458  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1200  putative AcnD-accessory protein PrpF  58.98 
 
 
417 aa  449  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  44.13 
 
 
384 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  36.02 
 
 
378 aa  252  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  40.1 
 
 
382 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  38.36 
 
 
403 aa  248  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  38.74 
 
 
386 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  35.96 
 
 
402 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  37.91 
 
 
363 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  35.99 
 
 
363 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  38.78 
 
 
386 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  36.92 
 
 
360 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  36.57 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  36.29 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  36.29 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.93 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  35.79 
 
 
361 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  35.71 
 
 
361 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2019  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  36.57 
 
 
372 aa  192  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0653361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.19 
 
 
370 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  34.19 
 
 
707 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3209  hypothetical protein  35.88 
 
 
369 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  34.37 
 
 
353 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4311  protein of unknown function DUF453  35.97 
 
 
381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  35.26 
 
 
698 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  35.6 
 
 
362 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.68 
 
 
684 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2033  hypothetical protein  34.77 
 
 
389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3339  protein of unknown function DUF453  35.47 
 
 
375 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03236  FldA  37.14 
 
 
351 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2818  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  37.7 
 
 
352 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0174979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  35.57 
 
 
359 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>