122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0582 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0582  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  804    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0535  AcnD-accessory protein PrpF  98.74 
 
 		 398 aa  796    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  71.65 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  71.65 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  71.65 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2337  hypothetical protein  71.65 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  hitchhiker  0.0000401834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3433  putative AcnD-accessory protein PrpF  71.14 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0190696  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  71.65 
 
 		 436 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  71.39 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  71.9 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  71.39 
 
 		 396 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  70.63 
 
 		 396 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  70.63 
 
 		 396 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  70.89 
 
 		 396 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  70.96 
 
 		 397 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  70 
 
 		 395 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  70.63 
 
 		 396 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  70.63 
 
 		 396 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  70.63 
 
 		 396 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  70.63 
 
 		 396 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1938  AcnD-accessory protein PrpF  70.89 
 
 		 396 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  69.95 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  71.83 
 
 		 391 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  70.38 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  71.65 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1584  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  67.93 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00480301  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  70.44 
 
 		 392 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  68.81 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  66.75 
 
 		 410 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6079  AcnD-accessory protein PrpF  69.74 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  70.08 
 
 		 396 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3632  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  69.07 
 
 		 397 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  68.64 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4024  putative AcnD-accessory protein PrpF  67.25 
 
 		 407 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02726  probable AcnD-accessory protein PrpF  71.84 
 
 		 386 aa  537  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1767  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  68.8 
 
 		 403 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  69.85 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1667  PrpF, AcnD-accessory  69.69 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.870319  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  67.09 
 
 		 407 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  67.09 
 
 		 407 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  69.85 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  68.3 
 
 		 397 aa  534  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  67.1 
 
 		 392 aa  531  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  68.3 
 
 		 397 aa  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  68.97 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2602  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  69.21 
 
 		 392 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000005222  hitchhiker  0.0000122233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4143  putative AcnD-accessory protein PrpF  66.5 
 
 		 407 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  69.13 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  68.02 
 
 		 395 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3297  hypothetical protein  69.05 
 
 		 396 aa  522  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  67.95 
 
 		 395 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3586  AcnD-accessory protein PrpF  68.19 
 
 		 398 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716521  normal  0.0110603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  70.38 
 
 		 400 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  65.89 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  70.63 
 
 		 400 aa  521  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1866  putative AcnD-accessory protein PrpF  64.19 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.477941  normal  0.214454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1422  putative AcnD-accessory protein PrpF  65.41 
 
 		 409 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0955  putative AcnD-accessory protein PrpF  65.12 
 
 		 400 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4788  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  67.51 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.343544  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  62.44 
 
 		 395 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03373  putative AcnD-accessory protein PrpF  64.18 
 
 		 409 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2819  AcnD-accessory protein PrpF  65.37 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0822115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2319  putative AcnD-accessory protein PrpF  65.24 
 
 		 426 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2496  AcnD-accessory protein PrpF  64.05 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.945381  hitchhiker  0.00398819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1860  putative AcnD-accessory protein PrpF  65.38 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  61.95 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2114  putative AcnD-accessory protein PrpF  64.38 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1115  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  56.03 
 
 		 413 aa  431  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1306  PrpF, AcnD-accessory  54.86 
 
 		 413 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1200  putative AcnD-accessory protein PrpF  55.39 
 
 		 417 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  41.84 
 
 		 384 aa  259  9e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  36.52 
 
 		 378 aa  252  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  39.95 
 
 		 403 aa  249  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  40.72 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  39.01 
 
 		 386 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  38.66 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  36.88 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  38.19 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  38.11 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  38.4 
 
 		 361 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  36.48 
 
 		 363 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  37.14 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.31 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  35.71 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  34.28 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  34.64 
 
 		 698 aa  180  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2019  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  36.8 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0653361  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2033  hypothetical protein  34.86 
 
 		 389 aa  176  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3577  hypothetical protein  36.15 
 
 		 359 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353102  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  34.36 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  35.08 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.09 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4311  protein of unknown function DUF453  33.85 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  36.43 
 
 		 359 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03236  FldA  36.72 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0299  hypothetical protein  35.03 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3209  hypothetical protein  34.44 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2818  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.86 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0174979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  33.07 
 
 		 707 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>