123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0328 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  100 
 
 		 370 aa  741    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  67.69 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  67.69 
 
 		 361 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  67.41 
 
 		 370 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  66.76 
 
 		 360 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  63.03 
 
 		 363 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  63.71 
 
 		 363 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2818  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  61.78 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0174979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  56.79 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4025  protein of unknown function DUF453  58.24 
 
 		 367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  0.0966594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3889  hypothetical protein  58.38 
 
 		 365 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0988  hypothetical protein  56.82 
 
 		 387 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.375128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0878  hypothetical protein  55.8 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5177  protein of unknown function DUF453  55.43 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.841395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4451  hypothetical protein  56.64 
 
 		 388 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2033  hypothetical protein  54.69 
 
 		 389 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03236  FldA  57.55 
 
 		 351 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3706  hypothetical protein  54.12 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0396378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  52.13 
 
 		 395 aa  359  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3209  hypothetical protein  52.62 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3577  hypothetical protein  52.84 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353102  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  49.16 
 
 		 698 aa  330  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  49.58 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3163  hypothetical protein  49 
 
 		 359 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1269  hypothetical protein  47.59 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  48.58 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  46.81 
 
 		 684 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  45.66 
 
 		 353 aa  316  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  46.67 
 
 		 707 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2873  protein of unknown function DUF453  45.71 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200218  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0796  hypothetical protein  45.71 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.872175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2893  hypothetical protein  45.71 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.210089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0792  hypothetical protein  45.43 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0873  hypothetical protein  45.71 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2055  hypothetical protein  49.43 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0823  hypothetical protein  45.71 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2588  hypothetical protein  45.43 
 
 		 350 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3685  hypothetical protein  48.86 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0299  hypothetical protein  47.89 
 
 		 375 aa  295  8e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1879  hypothetical protein  37.57 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  36.17 
 
 		 378 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  41.01 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  40.05 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  40.1 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  38.58 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  36.99 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.62 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.88 
 
 		 403 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  36.39 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.04 
 
 		 397 aa  206  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  37.5 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.78 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  34.87 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  36.84 
 
 		 386 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3632  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.53 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  36.99 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.53 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  36.08 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1584  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.13 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00480301  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  35.95 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0955  putative AcnD-accessory protein PrpF  36.99 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  35.95 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3339  protein of unknown function DUF453  37.47 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.52 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4143  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.28 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  34.67 
 
 		 407 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  35.64 
 
 		 395 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.88 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  35.73 
 
 		 392 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4024  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.42 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3586  AcnD-accessory protein PrpF  36.2 
 
 		 398 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716521  normal  0.0110603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  37.15 
 
 		 396 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  36.64 
 
 		 396 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  36.9 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  35.13 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  36.9 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03373  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.97 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1767  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.29 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.55 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.08 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2319  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.11 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1422  putative AcnD-accessory protein PrpF  33.92 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.99 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  35.55 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  35.44 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.23 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  36.73 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2496  AcnD-accessory protein PrpF  34.36 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.945381  hitchhiker  0.00398819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  35.73 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4311  protein of unknown function DUF453  35.45 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02726  probable AcnD-accessory protein PrpF  36.79 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  36.36 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  36.36 
 
 		 400 aa  186  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.87 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  34.7 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3297  hypothetical protein  34.52 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  36.71 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2114  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.51 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6079  AcnD-accessory protein PrpF  34.62 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  34.7 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>