122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1048 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  100 
 
 		 403 aa  805    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  54.79 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  49.74 
 
 		 386 aa  339  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  39.79 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  37.44 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2602  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  40.56 
 
 		 392 aa  262  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000005222  hitchhiker  0.0000122233 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  42.97 
 
 		 386 aa  262  8e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  40.36 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  38.86 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  39.49 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  40.1 
 
 		 396 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  38.62 
 
 		 410 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  40.1 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  40.1 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  40.66 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  40.41 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03373  putative AcnD-accessory protein PrpF  38.4 
 
 		 409 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1938  AcnD-accessory protein PrpF  39.33 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  38.36 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  37.03 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  39.34 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3433  putative AcnD-accessory protein PrpF  39.59 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0190696  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  39.34 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  40.42 
 
 		 382 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2337  hypothetical protein  39.33 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  hitchhiker  0.0000401834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6079  AcnD-accessory protein PrpF  39.69 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  39.75 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1584  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  38.78 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00480301  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  40.05 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1667  PrpF, AcnD-accessory  38.25 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.870319  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  39.85 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  39.64 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  36.84 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  37.24 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  38.34 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  39.33 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1422  putative AcnD-accessory protein PrpF  38 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0955  putative AcnD-accessory protein PrpF  37.5 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  39.13 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  39.33 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  38.62 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  39.59 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  37.15 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  39.85 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4143  putative AcnD-accessory protein PrpF  37.28 
 
 		 407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  36.52 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3632  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  36.48 
 
 		 397 aa  245  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  36.83 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  38.68 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  38.89 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0582  hypothetical protein  40.46 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1767  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  38.05 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  37.85 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02726  probable AcnD-accessory protein PrpF  39.58 
 
 		 386 aa  244  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  38.87 
 
 		 436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  38.62 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  38.62 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  38.62 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  38.62 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  36.27 
 
 		 407 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  38.62 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  38.62 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  39.58 
 
 		 402 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  38.62 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4024  putative AcnD-accessory protein PrpF  36.27 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0535  AcnD-accessory protein PrpF  40.2 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3586  AcnD-accessory protein PrpF  37.72 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716521  normal  0.0110603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1866  putative AcnD-accessory protein PrpF  36.43 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.477941  normal  0.214454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2819  AcnD-accessory protein PrpF  35.26 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0822115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3297  hypothetical protein  36.96 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2496  AcnD-accessory protein PrpF  36.67 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.945381  hitchhiker  0.00398819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1269  hypothetical protein  38.73 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1860  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.13 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  39.2 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2319  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.06 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3163  hypothetical protein  39.2 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2114  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.71 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1200  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.18 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.17 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  36.15 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4788  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  38.32 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.343544  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1115  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  35.62 
 
 		 363 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1306  PrpF, AcnD-accessory  33.92 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1879  hypothetical protein  32.72 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3685  hypothetical protein  37.33 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2055  hypothetical protein  37.07 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3577  hypothetical protein  36.34 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353102  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0823  hypothetical protein  36 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0792  hypothetical protein  35.47 
 
 		 350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533425  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2873  protein of unknown function DUF453  35.73 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  35.18 
 
 		 707 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0796  hypothetical protein  35.73 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.872175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2893  hypothetical protein  35.73 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.210089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4311  protein of unknown function DUF453  37.21 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  34.56 
 
 		 360 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0873  hypothetical protein  35.47 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2588  hypothetical protein  35.47 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  31.99 
 
 		 353 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  35.43 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>