123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1879 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1879  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  717    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  43.82 
 
 		 684 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  42.54 
 
 		 707 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  41.48 
 
 		 698 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  41.34 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1269  hypothetical protein  40.17 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  41.88 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0792  hypothetical protein  41.29 
 
 		 350 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533425  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2873  protein of unknown function DUF453  41.29 
 
 		 350 aa  299  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200218  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0796  hypothetical protein  41.29 
 
 		 350 aa  299  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.872175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2893  hypothetical protein  41.29 
 
 		 350 aa  299  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.210089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0823  hypothetical protein  41.29 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0873  hypothetical protein  41.29 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2588  hypothetical protein  41.29 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3163  hypothetical protein  42.17 
 
 		 359 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  42.45 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2055  hypothetical protein  41.31 
 
 		 359 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3685  hypothetical protein  41.03 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3889  hypothetical protein  39 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  40 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  37.89 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2818  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  39.43 
 
 		 352 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0174979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3577  hypothetical protein  37.32 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353102  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  38.75 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0299  hypothetical protein  36.11 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  38.46 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  38.46 
 
 		 361 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5177  protein of unknown function DUF453  37.46 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.841395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0878  hypothetical protein  37.18 
 
 		 372 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0988  hypothetical protein  36.72 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.375128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  37.57 
 
 		 370 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  37.33 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2033  hypothetical protein  36.14 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03236  FldA  34.56 
 
 		 351 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3209  hypothetical protein  34.82 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  35.21 
 
 		 360 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4025  protein of unknown function DUF453  37.85 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  0.0966594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4451  hypothetical protein  33.79 
 
 		 388 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  35.42 
 
 		 395 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  37.67 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3706  hypothetical protein  34.62 
 
 		 382 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0396378 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  31.08 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  32.46 
 
 		 403 aa  199  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  30.03 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  33.07 
 
 		 386 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  30.13 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  27.97 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  32.78 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4311  protein of unknown function DUF453  29.87 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  28.93 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1584  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  29.34 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00480301  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  29.31 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  30.08 
 
 		 397 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  30.33 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3339  protein of unknown function DUF453  29.95 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2602  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  28.17 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000005222  hitchhiker  0.0000122233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  29.41 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  28.9 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  29.16 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  29.16 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  28.57 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  29.31 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  28.9 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  29.16 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  29.16 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  29.16 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  29.82 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3632  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  29.31 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  28.79 
 
 		 395 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  29.26 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  28.39 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6079  AcnD-accessory protein PrpF  28.17 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03373  putative AcnD-accessory protein PrpF  28.91 
 
 		 409 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0582  hypothetical protein  29.74 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  28.13 
 
 		 396 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  28.13 
 
 		 396 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  28.13 
 
 		 396 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  28.13 
 
 		 396 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  28.75 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  28.13 
 
 		 396 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  28.13 
 
 		 396 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3297  hypothetical protein  28.83 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  28.13 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  27.32 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4024  putative AcnD-accessory protein PrpF  28.75 
 
 		 407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0535  AcnD-accessory protein PrpF  28.97 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  27.69 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  27.69 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0955  putative AcnD-accessory protein PrpF  28.39 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4143  putative AcnD-accessory protein PrpF  28.75 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  27.3 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  28.09 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  27.62 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  28.35 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  27.81 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  28.06 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  27.62 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  28.06 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  28.24 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1767  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  28.53 
 
 		 403 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>