122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1266 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  747    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  57.07 
 
 		 386 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  54.26 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  52.67 
 
 		 386 aa  319  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  45.33 
 
 		 402 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  37.63 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  42.3 
 
 		 396 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  42.15 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  43.78 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  43.34 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  44.07 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  44.13 
 
 		 396 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  44.13 
 
 		 396 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  44.13 
 
 		 396 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  44.13 
 
 		 396 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  44.13 
 
 		 396 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  44.13 
 
 		 396 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  43.64 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  44.13 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  42.3 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  42.19 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  43.81 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  42.3 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  42.6 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  41.1 
 
 		 410 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  43.86 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  42.15 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1584  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  40.52 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00480301  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6079  AcnD-accessory protein PrpF  41.56 
 
 		 395 aa  262  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  43.05 
 
 		 386 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02726  probable AcnD-accessory protein PrpF  43.27 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1767  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  40.84 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2602  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  42.26 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000005222  hitchhiker  0.0000122233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3586  AcnD-accessory protein PrpF  41.73 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716521  normal  0.0110603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2337  hypothetical protein  40.84 
 
 		 396 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  hitchhiker  0.0000401834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  39.06 
 
 		 389 aa  258  8e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  42.86 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  42.6 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  42.34 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  42.34 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  42.34 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  38.48 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3433  putative AcnD-accessory protein PrpF  40.31 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0190696  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  39.43 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  42.34 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3632  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  39.69 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  39.79 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  39.01 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  40.41 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4024  putative AcnD-accessory protein PrpF  38.56 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  39.63 
 
 		 392 aa  252  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1938  AcnD-accessory protein PrpF  40.47 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190692 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0582  hypothetical protein  41.84 
 
 		 398 aa  252  7e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  38.82 
 
 		 407 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  42.08 
 
 		 396 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  40.98 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  38.54 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0535  AcnD-accessory protein PrpF  41.58 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  38.48 
 
 		 397 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  40.16 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03373  putative AcnD-accessory protein PrpF  39.26 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  38.56 
 
 		 407 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4143  putative AcnD-accessory protein PrpF  38.3 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1667  PrpF, AcnD-accessory  40.32 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.870319  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1860  putative AcnD-accessory protein PrpF  37.99 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4788  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  42.71 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.343544  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2114  putative AcnD-accessory protein PrpF  41.1 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0955  putative AcnD-accessory protein PrpF  39.05 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2319  putative AcnD-accessory protein PrpF  39.74 
 
 		 426 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3577  hypothetical protein  42.97 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353102  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  42.86 
 
 		 382 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1866  putative AcnD-accessory protein PrpF  38.52 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.477941  normal  0.214454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  38.77 
 
 		 353 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2496  AcnD-accessory protein PrpF  38.74 
 
 		 405 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.945381  hitchhiker  0.00398819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4311  protein of unknown function DUF453  40 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2819  AcnD-accessory protein PrpF  37.96 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0822115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3297  hypothetical protein  40.26 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1422  putative AcnD-accessory protein PrpF  38.21 
 
 		 409 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1115  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  37.08 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3163  hypothetical protein  41.11 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1269  hypothetical protein  41.16 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  40.36 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  41.53 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  40.1 
 
 		 370 aa  222  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  38.1 
 
 		 363 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  39.21 
 
 		 684 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  39.31 
 
 		 360 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  39.21 
 
 		 707 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03236  FldA  41.38 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3889  hypothetical protein  38.22 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1306  PrpF, AcnD-accessory  36.48 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  37.63 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2055  hypothetical protein  40.74 
 
 		 359 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3685  hypothetical protein  40.74 
 
 		 370 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0299  hypothetical protein  40.37 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.26 
 
 		 698 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  38.73 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  38.85 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  39.63 
 
 		 361 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1200  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.83 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>