122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003391 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0955  putative AcnD-accessory protein PrpF  81.65 
 
 		 400 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  100 
 
 		 398 aa  814    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  91.77 
 
 		 395 aa  734    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  75.71 
 
 		 392 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  78.35 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3632  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  77.58 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  77.58 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  77.32 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  77.78 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  75.13 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  73.92 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  75.13 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1584  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  74.18 
 
 		 397 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00480301  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  75.13 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  75.13 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  75.13 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  74.87 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  75.13 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  74.55 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  73.43 
 
 		 436 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  75.06 
 
 		 395 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1767  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  74.94 
 
 		 403 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  74.81 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  71.76 
 
 		 410 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6079  AcnD-accessory protein PrpF  74.81 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  75.06 
 
 		 395 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  73.6 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  73.91 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  73.35 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  73.35 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  73.04 
 
 		 407 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  74.61 
 
 		 391 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2114  putative AcnD-accessory protein PrpF  73.92 
 
 		 405 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  73.6 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4024  putative AcnD-accessory protein PrpF  72.79 
 
 		 407 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  72.79 
 
 		 407 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  73.91 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  75.19 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  72.34 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  72.15 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2496  AcnD-accessory protein PrpF  73.4 
 
 		 405 aa  578  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.945381  hitchhiker  0.00398819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  72.59 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1667  PrpF, AcnD-accessory  72.28 
 
 		 398 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.870319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2602  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  74.16 
 
 		 392 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000005222  hitchhiker  0.0000122233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1860  putative AcnD-accessory protein PrpF  75.65 
 
 		 389 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2319  putative AcnD-accessory protein PrpF  73.1 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4143  putative AcnD-accessory protein PrpF  72.66 
 
 		 407 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2337  hypothetical protein  71.9 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  hitchhiker  0.0000401834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2819  AcnD-accessory protein PrpF  71.36 
 
 		 397 aa  574  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0822115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1866  putative AcnD-accessory protein PrpF  70.56 
 
 		 397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.477941  normal  0.214454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  71.65 
 
 		 389 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03373  putative AcnD-accessory protein PrpF  72.82 
 
 		 409 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1938  AcnD-accessory protein PrpF  72.34 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  73.39 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3433  putative AcnD-accessory protein PrpF  71.83 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0190696  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  72.31 
 
 		 395 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  72.31 
 
 		 395 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3586  AcnD-accessory protein PrpF  70.81 
 
 		 398 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716521  normal  0.0110603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  70.59 
 
 		 392 aa  552  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3297  hypothetical protein  70.77 
 
 		 396 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1422  putative AcnD-accessory protein PrpF  68.22 
 
 		 409 aa  547  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02726  probable AcnD-accessory protein PrpF  70.57 
 
 		 386 aa  542  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  69.54 
 
 		 400 aa  519  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  69.54 
 
 		 400 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4788  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  65.91 
 
 		 398 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.343544  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0582  hypothetical protein  61.95 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0535  AcnD-accessory protein PrpF  61.7 
 
 		 398 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1115  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  60.84 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1306  PrpF, AcnD-accessory  60.89 
 
 		 413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1200  putative AcnD-accessory protein PrpF  57.69 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  36.9 
 
 		 378 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  38.54 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  36.27 
 
 		 403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  37.73 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  37.04 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  36.83 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  36.99 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  35.79 
 
 		 360 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  35.97 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  36.96 
 
 		 363 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  38.05 
 
 		 386 aa  206  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  34.95 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  36.8 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3209  hypothetical protein  35.29 
 
 		 369 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  34.44 
 
 		 361 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  34.18 
 
 		 361 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  32.65 
 
 		 707 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  34.46 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3889  hypothetical protein  35.29 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.42 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  32.56 
 
 		 684 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  33.68 
 
 		 698 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  33.25 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0988  hypothetical protein  34.61 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.375128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2019  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.65 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0653361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4311  protein of unknown function DUF453  33.25 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3706  hypothetical protein  33.42 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0396378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2033  hypothetical protein  34.09 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0299  hypothetical protein  33.08 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5177  protein of unknown function DUF453  33.59 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.841395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>