122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1200 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1115  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  84.8 
 
 		 413 aa  702    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1306  PrpF, AcnD-accessory  83.17 
 
 		 413 aa  693    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1200  putative AcnD-accessory protein PrpF  100 
 
 		 417 aa  860    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  62.68 
 
 		 392 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  63.28 
 
 		 389 aa  494  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23250  acnD accessory protein  61.99 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2819  AcnD-accessory protein PrpF  62.23 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0822115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1422  putative AcnD-accessory protein PrpF  61.27 
 
 		 409 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3586  AcnD-accessory protein PrpF  60.1 
 
 		 398 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716521  normal  0.0110603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  62.08 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4024  putative AcnD-accessory protein PrpF  60.28 
 
 		 407 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  61.02 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2337  hypothetical protein  61.89 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  hitchhiker  0.0000401834 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  61.86 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  61.86 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  60.05 
 
 		 407 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3433  putative AcnD-accessory protein PrpF  61.65 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0190696  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  59.81 
 
 		 407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  61.26 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1767  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  59.67 
 
 		 403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3632  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  61.69 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  61.45 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2602  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  60.05 
 
 		 392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000005222  hitchhiker  0.0000122233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1860  putative AcnD-accessory protein PrpF  62.13 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  58.15 
 
 		 410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03373  putative AcnD-accessory protein PrpF  61.03 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2319  putative AcnD-accessory protein PrpF  59.62 
 
 		 426 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4143  putative AcnD-accessory protein PrpF  59.81 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1938  AcnD-accessory protein PrpF  61.41 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190692 
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  61.12 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  61.35 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1584  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  59.32 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00480301  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  58.88 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1866  putative AcnD-accessory protein PrpF  59.32 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.477941  normal  0.214454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  59.12 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2114  putative AcnD-accessory protein PrpF  59.31 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2496  AcnD-accessory protein PrpF  59.28 
 
 		 405 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.945381  hitchhiker  0.00398819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  59.95 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1667  PrpF, AcnD-accessory  60.1 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.870319  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4839  putative AcnD-accessory protein PrpF  59.47 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  60.78 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  57.49 
 
 		 395 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  59.71 
 
 		 396 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5386  AcnD-accessory protein PrpF  59.71 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  59.71 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  59.71 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  60.39 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  59.95 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  58.98 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  58.98 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  59.05 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3025  AcnD-accessory protein PrpF  58.29 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3297  hypothetical protein  57.95 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  57.69 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  58.98 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  58.98 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  58.98 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  58.98 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  58.98 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0955  putative AcnD-accessory protein PrpF  58.56 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  59.9 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  58.58 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  59.56 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02726  probable AcnD-accessory protein PrpF  59.9 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  59.66 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  59.66 
 
 		 400 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6079  AcnD-accessory protein PrpF  59.56 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4788  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  56.69 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.343544  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0582  hypothetical protein  55.39 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0535  AcnD-accessory protein PrpF  55.15 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  36.36 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  37.68 
 
 		 382 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  35.41 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.7 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  34.83 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  36.36 
 
 		 386 aa  186  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  34.96 
 
 		 363 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  32.02 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  35.29 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  35.41 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.5 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.66 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  33.91 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  34.9 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  32.02 
 
 		 360 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3339  protein of unknown function DUF453  32.51 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  33.17 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  33.42 
 
 		 361 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  33.01 
 
 		 698 aa  167  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1269  hypothetical protein  33.75 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3163  hypothetical protein  33.83 
 
 		 359 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2873  protein of unknown function DUF453  32.92 
 
 		 350 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0873  hypothetical protein  32.92 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0796  hypothetical protein  32.92 
 
 		 350 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.872175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2893  hypothetical protein  32.92 
 
 		 350 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.210089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0792  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0823  hypothetical protein  32.67 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3889  hypothetical protein  31.57 
 
 		 365 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2588  hypothetical protein  32.92 
 
 		 350 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>