More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2301 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2301  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  685    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.100288  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4353  hypothetical protein  29.69 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0875589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2061  hypothetical protein  30.04 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  28.9 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  28.4 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  34.88 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  30.26 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  26.28 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  28.27 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  26.46 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6277  hypothetical protein  27.9 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  30.2 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  27.78 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  29.39 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  25.76 
 
 		 350 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0711  hypothetical protein  31.84 
 
 		 277 aa  96.3  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.926486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  28.32 
 
 		 317 aa  96.3  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  30.71 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  30.13 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  30.33 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  30.71 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3114  hypothetical protein  28.9 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  28.81 
 
 		 335 aa  93.6  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  29.55 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  29.89 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  28.16 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 		 332 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  28.47 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  27.27 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  31.5 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  29.97 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  26.06 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  29.56 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  27.08 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  27.81 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  26.93 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  29.32 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  27.41 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  29.3 
 
 		 322 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  28.87 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  28.62 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  28.33 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  32.17 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  27.41 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1128  putative tricarboxylate transporter, periplasmic ligand binding protein (TctC subunit))  29.96 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  28.98 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  34.55 
 
 		 340 aa  89.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  31.2 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  30.47 
 
 		 322 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  29.8 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  30.1 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  29.63 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  28.41 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  31.21 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  27.53 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  26.21 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  26.79 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4453  hypothetical protein  28.73 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  24.58 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2926  hypothetical protein  27.34 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  25.31 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  29.59 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  32.11 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  27.36 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1907  hypothetical protein  28.4 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.653438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6079  hypothetical protein  30.77 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  26.44 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  26.8 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  28.07 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  26.85 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  26.6 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  30.63 
 
 		 353 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  26.01 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  28.35 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  28.82 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  27.76 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  30.41 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  30.04 
 
 		 326 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  29.68 
 
 		 331 aa  86.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  28.09 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  28.89 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  29.87 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  28.14 
 
 		 698 aa  86.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  25.49 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  29.48 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  27.24 
 
 		 342 aa  85.9  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  28.41 
 
 		 328 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  31.94 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3705  hypothetical protein  32.13 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  28.67 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  28.69 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3797  extra-cytoplasmic solute receptor  26.69 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  29.04 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4640  hypothetical protein  33.05 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  26.88 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  28.93 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  28.66 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  29.04 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>