More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1895 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1895  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 819 aa  1644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.288802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1068  peptidoglycan glycosyltransferase  49.6 
 
 		 782 aa  580  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219806  normal  0.42759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2706  glycosyl transferase family 51  42.86 
 
 		 728 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488127  normal  0.218116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1642  family 51 glycosyl transferase  42.31 
 
 		 748 aa  444  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000308758  normal  0.607604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  35.39 
 
 		 640 aa  308  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.79 
 
 		 640 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.46 
 
 		 751 aa  302  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34 
 
 		 654 aa  296  8e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35.31 
 
 		 618 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.98 
 
 		 648 aa  290  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  33.13 
 
 		 643 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  35.41 
 
 		 905 aa  288  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.76 
 
 		 795 aa  287  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  33.55 
 
 		 708 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 765 aa  284  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.3 
 
 		 648 aa  284  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  32.92 
 
 		 646 aa  283  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.18 
 
 		 643 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.18 
 
 		 643 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.38 
 
 		 661 aa  280  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  29.53 
 
 		 828 aa  271  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.07 
 
 		 625 aa  270  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  32.85 
 
 		 728 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.09 
 
 		 806 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33.81 
 
 		 727 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  33.81 
 
 		 727 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.84 
 
 		 761 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32.96 
 
 		 770 aa  267  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  33.02 
 
 		 728 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  31.45 
 
 		 655 aa  266  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  32.44 
 
 		 727 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  34.21 
 
 		 744 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  33.55 
 
 		 662 aa  262  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  32.49 
 
 		 669 aa  261  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  33.5 
 
 		 683 aa  260  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  32.45 
 
 		 683 aa  260  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  32.45 
 
 		 683 aa  260  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  32.28 
 
 		 683 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  31.38 
 
 		 704 aa  259  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  33.61 
 
 		 755 aa  258  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  32.28 
 
 		 683 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  32.39 
 
 		 714 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  32.28 
 
 		 683 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  28.77 
 
 		 642 aa  258  4e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  31.95 
 
 		 683 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  32.54 
 
 		 723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  32.63 
 
 		 679 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  33.02 
 
 		 775 aa  255  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.76 
 
 		 761 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.11 
 
 		 642 aa  256  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  32.28 
 
 		 683 aa  255  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  35.34 
 
 		 712 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  32.06 
 
 		 714 aa  254  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  30.43 
 
 		 638 aa  253  7e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  33.99 
 
 		 701 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.75 
 
 		 811 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  32.12 
 
 		 683 aa  253  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  32.12 
 
 		 683 aa  252  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  35.27 
 
 		 718 aa  252  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  32.84 
 
 		 693 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  33.18 
 
 		 732 aa  251  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  33.17 
 
 		 656 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  32.52 
 
 		 754 aa  252  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.16 
 
 		 676 aa  251  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  30.78 
 
 		 720 aa  251  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.72 
 
 		 649 aa  251  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  32.9 
 
 		 667 aa  250  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  35.7 
 
 		 709 aa  250  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  32.47 
 
 		 776 aa  250  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  32.33 
 
 		 730 aa  250  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 727 aa  250  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  31.29 
 
 		 829 aa  250  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  31.79 
 
 		 683 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  32.18 
 
 		 763 aa  249  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.84 
 
 		 645 aa  248  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  30.47 
 
 		 833 aa  248  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  30.81 
 
 		 643 aa  247  6e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  30.81 
 
 		 643 aa  247  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  30.96 
 
 		 641 aa  247  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  31.07 
 
 		 712 aa  246  9e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  31.32 
 
 		 734 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  34.68 
 
 		 853 aa  246  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  34 
 
 		 796 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  33.61 
 
 		 742 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  32.81 
 
 		 726 aa  244  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 		 735 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  34.97 
 
 		 860 aa  243  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.23 
 
 		 734 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 		 927 aa  242  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  31.23 
 
 		 712 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  32.76 
 
 		 778 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  31.2 
 
 		 644 aa  241  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.89 
 
 		 779 aa  241  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  30.84 
 
 		 643 aa  241  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  30.73 
 
 		 776 aa  240  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  32.52 
 
 		 654 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.51 
 
 		 739 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  30.53 
 
 		 801 aa  237  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  33.01 
 
 		 846 aa  237  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  33.51 
 
 		 741 aa  237  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>