More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0537 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0457  ribonuclease, Rne/Rng family  67.71 
 
 		 489 aa  685    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  67.57 
 
 		 1076 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2376  ribonuclease, Rne/Rng family  77.53 
 
 		 491 aa  792    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0537  ribonuclease E  100 
 
 		 486 aa  1002    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0321  ribonuclease  78.8 
 
 		 489 aa  781    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.691253  normal  0.292271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3349  ribonuclease, Rne/Rng family  65.76 
 
 		 490 aa  632  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  42.77 
 
 		 926 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  42.17 
 
 		 792 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  43.34 
 
 		 495 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  41.16 
 
 		 866 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  40.5 
 
 		 808 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  41.26 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  41.21 
 
 		 806 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  39.92 
 
 		 741 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  40.46 
 
 		 919 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2220  ribonuclease, Rne/Rng family  40.38 
 
 		 782 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1874  ribonuclease, Rne/Rng family  40.38 
 
 		 782 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000717737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  40.99 
 
 		 903 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1040  ribonuclease E protein  40.38 
 
 		 1014 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0970  ribonuclease, Rne/Rng family  40.38 
 
 		 1008 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0905  ribonuclease, Rne/Rng family  40.59 
 
 		 1011 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0755598  normal  0.0613595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1756  ribonuclease, Rne/Rng family  40.08 
 
 		 1016 aa  355  6.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000532878  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  40.13 
 
 		 1092 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  41.45 
 
 		 1012 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  40.42 
 
 		 938 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2275  RNAse E  39.53 
 
 		 1042 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896581  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0986  ribonuclease  40.13 
 
 		 1068 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2922  ribonuclease, Rne/Rng family  39.58 
 
 		 1097 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000705961  normal  0.54344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1062  ribonuclease E  39.58 
 
 		 1096 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  0.00000580995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0703  ribonuclease  40.38 
 
 		 752 aa  350  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  40.13 
 
 		 1059 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0631  ribonuclease  39.92 
 
 		 1059 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0577121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1110  ribonuclease  39.92 
 
 		 1059 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  40.13 
 
 		 1053 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1069  ribonuclease  39.92 
 
 		 1056 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17751  decreased coverage  0.00648425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  37.7 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0389  ribonuclease  38.9 
 
 		 879 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.57215  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  39.7 
 
 		 1111 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1321  ribonuclease E  39.02 
 
 		 904 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0034947  normal  0.881501 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2440  RNAse E  39.11 
 
 		 1037 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1242  ribonuclease  40.8 
 
 		 928 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2491  ribonuclease E  39.7 
 
 		 1090 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0520  ribonuclease E  39.7 
 
 		 1090 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000787566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2791  ribonuclease E  39.7 
 
 		 1087 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000882056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  39.7 
 
 		 1088 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1814  ribonuclease E  39.7 
 
 		 1087 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0112079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2802  ribonuclease E  39.7 
 
 		 1088 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000361809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  40.72 
 
 		 1073 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1564  RNAse E  39.53 
 
 		 873 aa  347  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.270508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2918  ribonuclease E  39.87 
 
 		 1085 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000100731  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1707  ribonuclease E  39.87 
 
 		 1068 aa  346  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000337375  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0396  ribonuclease, Rne/Rng family  38.48 
 
 		 865 aa  345  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1590  ribonuclease E  39.58 
 
 		 720 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000584784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  40.89 
 
 		 1057 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  41.1 
 
 		 1072 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  40.89 
 
 		 1073 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  40.47 
 
 		 1082 aa  343  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  40.17 
 
 		 1056 aa  343  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4788  ribonuclease  37.61 
 
 		 1038 aa  342  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870424  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1481  ribonuclease  40.89 
 
 		 1086 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00984617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0595  ribonuclease  39.58 
 
 		 718 aa  342  8e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000095022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  40.89 
 
 		 1091 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  40.89 
 
 		 1090 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  40.47 
 
 		 1128 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2005  ribonuclease E  38.03 
 
 		 870 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2678  ribonuclease, Rne/Rng family  40 
 
 		 1091 aa  341  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.174133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3290  ribonuclease E  37.12 
 
 		 1025 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2436  ribonuclease, Rne/Rng family  39.1 
 
 		 1061 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  40.25 
 
 		 1139 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2643  ribonuclease, Rne/Rng family  37.12 
 
 		 1029 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  40.25 
 
 		 1120 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1615  ribonuclease E  40.52 
 
 		 688 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5282  ribonuclease  36.91 
 
 		 1044 aa  340  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0972122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  39.79 
 
 		 1238 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  40.38 
 
 		 1175 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  40.5 
 
 		 1035 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  40.3 
 
 		 1122 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000446531  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  37.9 
 
 		 1007 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  36.91 
 
 		 1074 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002988  ribonuclease E  41.03 
 
 		 1024 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1173  ribonuclease E  36.91 
 
 		 1040 aa  335  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1064  ribonuclease  38.72 
 
 		 977 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.973146  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  38.74 
 
 		 1132 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  39.74 
 
 		 1071 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  38.53 
 
 		 1132 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  39.45 
 
 		 1015 aa  333  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1677  ribonuclease E  39.87 
 
 		 1216 aa  332  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000377607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1569  ribonuclease E  39.87 
 
 		 1216 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000219809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3507  ribonuclease E  39.87 
 
 		 1216 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0058516  normal  0.0230667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1579  ribonuclease, Rne/Rng family  39.87 
 
 		 1060 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00521114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2511  ribonuclease E  39.66 
 
 		 1113 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00474333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1615  ribonuclease, Rne/Rng family  39.87 
 
 		 1058 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000319313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3086  ribonuclease  37.47 
 
 		 1076 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1600  ribonuclease E  40.09 
 
 		 1048 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1207  ribonuclease E  39.45 
 
 		 1061 aa  328  9e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1207  ribonuclease E  39.45 
 
 		 1061 aa  329  9e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2816  ribonuclease E  39.45 
 
 		 1121 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00267025  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2241  ribonuclease E  39.45 
 
 		 1061 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000115068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  38.14 
 
 		 1084 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1463  ribonuclease E  39.45 
 
 		 1061 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00215249  hitchhiker  0.000000103406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>