More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0918 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 		 205 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  84.39 
 
 		 204 aa  358  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  80 
 
 		 205 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  79.51 
 
 		 205 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  76.59 
 
 		 222 aa  327  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  76.59 
 
 		 222 aa  327  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  76.1 
 
 		 222 aa  325  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  78.05 
 
 		 206 aa  321  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  68.97 
 
 		 204 aa  298  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.55 
 
 		 204 aa  197  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  51.78 
 
 		 205 aa  194  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  50.5 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49.24 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.52 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.76 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  48.42 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.72 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.37 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.37 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.4 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.5 
 
 		 227 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.36 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.74 
 
 		 218 aa  160  9e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.74 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.84 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.27 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.81 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.84 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.79 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  42.78 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  38.95 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.5 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  44.38 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.45 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.82 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.82 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.07 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.17 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  34.15 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.15 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.5 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.16 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.16 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.16 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.16 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.16 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.16 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.16 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.84 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.84 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.18 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.16 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.97 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  31.68 
 
 		 559 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  30.46 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  31.05 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  26.8 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89976  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234213  decreased coverage  0.00849343 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  27.36 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5230  L-fuculose-phosphate aldolase  25.89 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  28.71 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.88 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  32.94 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  28.87 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  28.57 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  26.9 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  34.65 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  27.67 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  27.57 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  37.5 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  32.41 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  26.86 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  24.34 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.63 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.63 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  27.08 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  27.46 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1055  hypothetical protein  23.98 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  24.87 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1383  hypothetical protein  23.35 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3961  hypothetical protein  23.35 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  26.34 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  32.76 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  26.09 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  25.5 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  35.56 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  31.55 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  28.02 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  35.05 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  31.68 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  29.41 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  30.91 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  33.02 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  33.02 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1319  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.75 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  26.34 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  28.43 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  24.34 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>