More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1410 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 
218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  97.71 
 
 
218 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  71.3 
 
 
213 aa  326  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  74.24 
 
 
208 aa  308  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  74.24 
 
 
208 aa  308  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  51.98 
 
 
207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  49.03 
 
 
208 aa  191  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.75 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  53.3 
 
 
205 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  51.96 
 
 
204 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  53.11 
 
 
208 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  51.96 
 
 
204 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.23 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.93 
 
 
203 aa  170  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.27 
 
 
227 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.88 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.28 
 
 
204 aa  165  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.8 
 
 
205 aa  165  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.88 
 
 
222 aa  164  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.88 
 
 
222 aa  164  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.96 
 
 
206 aa  161  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.25 
 
 
205 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.74 
 
 
205 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  44.62 
 
 
207 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.51 
 
 
208 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.43 
 
 
206 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.89 
 
 
204 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.86 
 
 
213 aa  138  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  39.69 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.09 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  39.71 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.15 
 
 
206 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  36.04 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.9 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.95 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.5 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.55 
 
 
210 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.59 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  34.59 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.91 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.33 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.53 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.16 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.29 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.65 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.29 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.65 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.65 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.65 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.65 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.65 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.85 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.85 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1383  hypothetical protein  24.87 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3961  hypothetical protein  24.87 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1223  hypothetical protein  24.87 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  25.48 
 
 
559 aa  72.8  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1246  hypothetical protein  24.85 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  28.57 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1420  hypothetical protein  23.83 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306976 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1221  hypothetical protein  23.83 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00266219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1486  hypothetical protein  24.35 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2736  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.94 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.33 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1445  hypothetical protein  24.35 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1055  hypothetical protein  23.08 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0648  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.68 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0125  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.59 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0147  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.31 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1862  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.93 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  39.58 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.47 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3928  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.68 
 
 
240 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000124129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  26.37 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  37.5 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1810  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.3 
 
 
238 aa  61.6  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00111407  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1319  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.94 
 
 
231 aa  61.6  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0481  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.09 
 
 
242 aa  61.6  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  27.27 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  29.05 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  27.08 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  25.12 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4656  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.66 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0985  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.56 
 
 
230 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4759  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.39 
 
 
228 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0855  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.11 
 
 
234 aa  58.2  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.121806  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  29.65 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4806  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.66 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  25.89 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3467  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.12 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.443237  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1120  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.57 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  37.93 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1381  class II aldolase/adducin family protein  32.89 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0497618  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0750  class II aldolase/adducin family protein  30.41 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4669  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.03 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4728  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.92 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.900627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.39 
 
 
228 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.792036  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4442  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.39 
 
 
228 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  25.4 
 
 
428 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0773  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.89 
 
 
231 aa  55.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>