More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0017 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 		 213 aa  428  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  56.28 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  51.01 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.55 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  45.6 
 
 		 204 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.08 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  46.5 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.1 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.98 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.71 
 
 		 206 aa  168  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.98 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.97 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.79 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.27 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.05 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.41 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.8 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.8 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.86 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.17 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.33 
 
 		 222 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.33 
 
 		 222 aa  147  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.33 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.35 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.86 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.44 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.5 
 
 		 206 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  38.31 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.78 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.44 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  37.7 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.33 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  37.43 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.57 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.57 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.46 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.8 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.33 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.17 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.72 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.57 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  36.57 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.63 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.58 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  31.15 
 
 		 265 aa  85.1  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.58 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.58 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.58 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.58 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.58 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.58 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.58 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.58 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  29.17 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.59 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  28.34 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  34.25 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  28.88 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  30 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  29.08 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  27.49 
 
 		 559 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  32.78 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.44 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  35.35 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  35.34 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  34.81 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  32.6 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  26.44 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  44.9 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  34.65 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4427  class II aldolase/adducin family protein  31.69 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  25.97 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  32.77 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.72 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  31.18 
 
 		 323 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  30.94 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  31.69 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  31.87 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  43.68 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  30.11 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  25.65 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  41.41 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  26.09 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  41.11 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  29.38 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  29.57 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  29.15 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  30.23 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  30.23 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  34.48 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  42.86 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  42.86 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  42.86 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  43.69 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  28.12 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  28.12 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  28.12 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  28.12 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>