More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1855 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 
204 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  94.61 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  85.78 
 
 
208 aa  370  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  80.79 
 
 
206 aa  353  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  82.74 
 
 
205 aa  346  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  82.23 
 
 
205 aa  345  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  63.73 
 
 
208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  56.02 
 
 
207 aa  228  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  53.54 
 
 
227 aa  221  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.55 
 
 
205 aa  197  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.74 
 
 
205 aa  197  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.25 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50 
 
 
222 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.24 
 
 
205 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
208 aa  191  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.53 
 
 
204 aa  191  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.83 
 
 
204 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49.49 
 
 
213 aa  185  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  51.96 
 
 
218 aa  181  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  51.96 
 
 
218 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.53 
 
 
208 aa  179  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.53 
 
 
208 aa  179  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.27 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.5 
 
 
213 aa  168  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  45.26 
 
 
207 aa  161  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.09 
 
 
206 aa  160  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.9 
 
 
216 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.4 
 
 
206 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.87 
 
 
195 aa  127  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  36.79 
 
 
206 aa  123  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.01 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.01 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.11 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.2 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.18 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37 
 
 
210 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.46 
 
 
215 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  32.97 
 
 
207 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.67 
 
 
212 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.2 
 
 
212 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.2 
 
 
212 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.67 
 
 
212 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.67 
 
 
212 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.67 
 
 
212 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.67 
 
 
212 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.67 
 
 
212 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.2 
 
 
212 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.73 
 
 
211 aa  99  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  31.52 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.52 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.2 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.5 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  30.3 
 
 
559 aa  89.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  30.3 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  30.11 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  42.7 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  31.61 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  27.36 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.73 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  40.4 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  29.56 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  30.32 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  34.62 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  37.5 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  36.89 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  36 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  38.78 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  28.06 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  38.3 
 
 
239 aa  67.8  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  28.17 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  39.09 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.69 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  30.57 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  36.79 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  36.79 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  25.64 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  38.18 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  36.45 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  27.23 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  33.64 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0648  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.73 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  27.81 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  35.58 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  38.18 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.53 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  27.46 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  35.14 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  26.83 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  36.08 
 
 
385 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  35.14 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  22.86 
 
 
240 aa  62.4  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  38.74 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  37.27 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  29.28 
 
 
189 aa  62  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4427  class II aldolase/adducin family protein  26.04 
 
 
266 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  34.55 
 
 
219 aa  61.6  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  25.51 
 
 
214 aa  61.6  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  40.54 
 
 
220 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>