More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3589 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 
205 aa  423  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  97.56 
 
 
205 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  81.77 
 
 
208 aa  352  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  82.23 
 
 
204 aa  345  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  83.25 
 
 
204 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  81.28 
 
 
206 aa  345  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  62.94 
 
 
208 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
207 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  53.5 
 
 
227 aa  214  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.76 
 
 
205 aa  203  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.26 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.76 
 
 
208 aa  194  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.26 
 
 
206 aa  193  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.66 
 
 
204 aa  193  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.5 
 
 
203 aa  192  3e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49.75 
 
 
222 aa  191  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49.75 
 
 
222 aa  191  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49.75 
 
 
222 aa  191  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.83 
 
 
204 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.76 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.28 
 
 
208 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.28 
 
 
208 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
218 aa  184  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  53.3 
 
 
218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50 
 
 
213 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  46.15 
 
 
207 aa  167  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.33 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49 
 
 
216 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.63 
 
 
213 aa  153  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.46 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  39.38 
 
 
206 aa  128  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.12 
 
 
215 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.37 
 
 
195 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.11 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.11 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.92 
 
 
205 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.11 
 
 
212 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.78 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  34.54 
 
 
206 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.54 
 
 
206 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  34.17 
 
 
207 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.29 
 
 
212 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.22 
 
 
210 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.06 
 
 
212 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.06 
 
 
212 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.06 
 
 
212 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.29 
 
 
212 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.06 
 
 
212 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.06 
 
 
212 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.06 
 
 
212 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.06 
 
 
212 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.82 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.94 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  29.29 
 
 
559 aa  84.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.93 
 
 
226 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  30.32 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  31.63 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  30.65 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  41 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  28.28 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  37.1 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  38.83 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  29.17 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  27.32 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  25.25 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.69 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.05 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4806  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.43 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  28.57 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  26.53 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  25.23 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  31.38 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  28.14 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2736  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.78 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  26.6 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0426  class II aldolase/adducin family protein  26.44 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000249785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.88 
 
 
214 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0648  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.7 
 
 
232 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  34.95 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  26.63 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  33.33 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  32.35 
 
 
264 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3955  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.93 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.918987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  27.5 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3928  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.37 
 
 
240 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000124129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.94 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.792036  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4442  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.94 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3891  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.93 
 
 
231 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4062  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.93 
 
 
231 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.612579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4656  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.41 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4000  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.93 
 
 
231 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.850049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4759  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.94 
 
 
228 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3875  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.93 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  28.42 
 
 
189 aa  61.6  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  34.58 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  24.74 
 
 
234 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3815  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.42 
 
 
228 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0563678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  37.5 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>