More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5230 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5230  L-fuculose-phosphate aldolase  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  40.54 
 
 		 753 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  32.52 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  35.48 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  35.48 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  31.18 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  32.43 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  34.95 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  34.95 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  34.95 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  34.95 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  34.41 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  34.41 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  32.56 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  34.41 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  29.61 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  29.02 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  26.56 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  30.9 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  29.61 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  31.33 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  28.85 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  28.81 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  32 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  30.54 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0856  L-fuculose phosphate aldolase, putative  30.14 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.668343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  30.89 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  27.45 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  32.95 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  33.52 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  30.11 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  32.37 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  32.11 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  29.61 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  28.18 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  30.68 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  31.45 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  32.61 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.89 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.27 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  31.18 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.37 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  29.83 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  31.34 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  29.05 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  27.32 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.27 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  30.39 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  32 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  29.56 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.37 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  25.45 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  29.38 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  31.07 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  31.11 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  31.07 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.6 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  29.35 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  31.25 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  27.88 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  30.32 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  31.05 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  28.93 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  27.33 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.88 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  30.51 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  27.07 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  25.68 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  33.33 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  31.11 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  31.82 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  26.25 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  27.44 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  27.33 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  29.25 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  30.73 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  27.37 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  21.78 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  29.13 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  27.68 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  29.89 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  25.37 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  28.57 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  25.68 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  31.02 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  27.12 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  28.64 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  27.04 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  25.58 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.4 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  29.41 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  23.76 
 
 		 428 aa  58.9  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  29.95 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>