More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0885 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  84.39 
 
 		 205 aa  358  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  82.35 
 
 		 205 aa  346  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  80.88 
 
 		 222 aa  344  5e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  80.88 
 
 		 222 aa  344  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  80.39 
 
 		 222 aa  342  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  81.86 
 
 		 205 aa  342  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  77.94 
 
 		 206 aa  322  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  65.84 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  53.19 
 
 		 205 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.66 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  52.06 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.53 
 
 		 204 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49.47 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.94 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  49.47 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.72 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.82 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.62 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.62 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.54 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.28 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.28 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.84 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.55 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.23 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.2 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.71 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  37.93 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.13 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.78 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  39.2 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  43.1 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.03 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.03 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  39.18 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.84 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.17 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.24 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.84 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  35.29 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.29 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.36 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.76 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.76 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.76 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.56 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.46 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.76 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.76 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.76 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.76 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.14 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  29.85 
 
 		 559 aa  93.2  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.86 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  32.22 
 
 		 332 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  31.25 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.52 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  26.56 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  27.32 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  36.45 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  28.5 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  36.11 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  30.41 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  29.65 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  26.89 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  28 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  29.57 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  29.33 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  32.4 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  30.29 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5230  L-fuculose-phosphate aldolase  26.6 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  27.47 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  29.44 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  28.26 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0063  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.38 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0680364  normal  0.805869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  30.46 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  27.32 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  29.07 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  26.53 
 
 		 428 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  27.4 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  32.17 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  27.84 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  39.36 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  22.87 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0053  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.33 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  27.75 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  27.75 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  28.26 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3596  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.75 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000129105 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3538  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.75 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0065  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.75 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00063  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.75 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0063  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.12 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0142427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  25.57 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0066  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.75 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00062  hypothetical protein  28.75 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  28.65 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  32.35 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  23.91 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>