176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0852 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  80.95 
 
 
210 aa  349  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  65.52 
 
 
212 aa  275  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  65.02 
 
 
212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  65.02 
 
 
212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  65.02 
 
 
212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  65.02 
 
 
212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  65.02 
 
 
212 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  65.02 
 
 
212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  64.53 
 
 
212 aa  272  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  64.53 
 
 
212 aa  272  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  65.02 
 
 
212 aa  272  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  64.04 
 
 
212 aa  270  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.78 
 
 
215 aa  198  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.65 
 
 
211 aa  181  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1055  hypothetical protein  43.84 
 
 
209 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1383  hypothetical protein  41.87 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3961  hypothetical protein  41.87 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1246  hypothetical protein  40.98 
 
 
209 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1223  hypothetical protein  41.38 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1221  hypothetical protein  41.38 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00266219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1420  hypothetical protein  41.38 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1445  hypothetical protein  40.89 
 
 
209 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1486  hypothetical protein  40.89 
 
 
209 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1247  hypothetical protein  43.85 
 
 
136 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.75 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  32.31 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.75 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.29 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.27 
 
 
203 aa  112  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.33 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.5 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.66 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.8 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.8 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.56 
 
 
204 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.22 
 
 
204 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.65 
 
 
227 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.68 
 
 
206 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  32.76 
 
 
207 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.65 
 
 
206 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.41 
 
 
205 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.41 
 
 
205 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.15 
 
 
195 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.31 
 
 
206 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  31.31 
 
 
206 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.76 
 
 
208 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.56 
 
 
206 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  32.18 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  34.02 
 
 
204 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.62 
 
 
207 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.16 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.2 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.74 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.74 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.74 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.94 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.33 
 
 
213 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.94 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.4 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  32.4 
 
 
207 aa  88.6  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.47 
 
 
226 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.59 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.11 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.26 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  27.65 
 
 
559 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  27 
 
 
252 aa  68.2  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89976  conserved hypothetical protein  28.38 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234213  decreased coverage  0.00849343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  27.09 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  28.42 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  27.72 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  27.66 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  28.28 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  33.58 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  25 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  25.12 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  26.7 
 
 
210 aa  58.5  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  25.37 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  25.9 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  27.6 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  31.06 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  28.08 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  23.94 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  27.75 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  36.17 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  29.26 
 
 
753 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.69 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  27.14 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  27.59 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  27.62 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.69 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  26.7 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1319  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.11 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  29.12 
 
 
398 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4427  class II aldolase/adducin family protein  28.78 
 
 
266 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  25.57 
 
 
214 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  32.75 
 
 
189 aa  52  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  26.29 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  25.95 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  25.95 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>