249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1268 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.25 
 
 
210 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.78 
 
 
213 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.43 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.91 
 
 
212 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.91 
 
 
212 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.91 
 
 
212 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.91 
 
 
212 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.91 
 
 
212 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.91 
 
 
212 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.91 
 
 
212 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.91 
 
 
212 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.91 
 
 
212 aa  191  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  46.39 
 
 
212 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.39 
 
 
211 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.2 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.2 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.94 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.12 
 
 
207 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.63 
 
 
203 aa  122  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  34.18 
 
 
207 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.96 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  37.02 
 
 
208 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.12 
 
 
205 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.1 
 
 
204 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.1 
 
 
204 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.33 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.95 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.12 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.22 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.41 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.02 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.56 
 
 
206 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.63 
 
 
206 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  29.08 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.17 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  36.46 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.46 
 
 
204 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.45 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.6 
 
 
206 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  30.6 
 
 
206 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.15 
 
 
195 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.07 
 
 
204 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.41 
 
 
205 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.05 
 
 
222 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.05 
 
 
222 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.05 
 
 
222 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.41 
 
 
205 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1383  hypothetical protein  31.9 
 
 
209 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3961  hypothetical protein  31.9 
 
 
209 aa  101  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1055  hypothetical protein  30.46 
 
 
209 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1223  hypothetical protein  31.53 
 
 
209 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1420  hypothetical protein  31.9 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306976 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1221  hypothetical protein  31.9 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00266219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1445  hypothetical protein  31.03 
 
 
209 aa  99  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.12 
 
 
226 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1486  hypothetical protein  31.9 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  39.31 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1246  hypothetical protein  29.9 
 
 
209 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.1 
 
 
206 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.03 
 
 
208 aa  92  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.89 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  31.07 
 
 
207 aa  88.2  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.7 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  28.99 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  27.93 
 
 
559 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1247  hypothetical protein  32.82 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  28.64 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  25.68 
 
 
244 aa  72  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  26.9 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89976  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234213  decreased coverage  0.00849343 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  28.16 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  29.28 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0823  class II aldolase/adducin family protein  29.28 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.345059  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1450  L-fuculose phosphate aldolase  33.13 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.571414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  34.12 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  26.6 
 
 
265 aa  61.6  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  29.14 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  25.58 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  29.07 
 
 
753 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  24.08 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  27.17 
 
 
188 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  38.82 
 
 
264 aa  58.9  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2898  class II aldolase/adducin family protein  24.26 
 
 
236 aa  58.2  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.38221  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  27.59 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  28.73 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0855  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.81 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.121806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  29.52 
 
 
227 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1529  class II aldolase/adducin family protein  26.24 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599207  normal  0.531556 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  23.96 
 
 
234 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0750  class II aldolase/adducin family protein  31.07 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  24.34 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  27.07 
 
 
428 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  27.07 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  25.52 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  28.12 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  27.55 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  24.75 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  23.04 
 
 
323 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>