More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0598 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.24 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.76 
 
 		 204 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.76 
 
 		 204 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.91 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.62 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.23 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  34.87 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.54 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.5 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.6 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.02 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.29 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.16 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.36 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.15 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.66 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.31 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.98 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.56 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.67 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.8 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.52 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.59 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  31.52 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.3 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.38 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.59 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  31.68 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.36 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.36 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.08 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.69 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.86 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.16 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.86 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.05 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.27 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  25.71 
 
 		 559 aa  79  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.26 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  29.56 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.9 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  29.17 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  31 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  39.6 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  34.74 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  38.38 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  25.74 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  28.57 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  27.72 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  25 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  29.14 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  36.56 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  29.74 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  28.21 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  31.12 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  29.29 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  29.23 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  27.6 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  36.56 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  33.98 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  35.48 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  32.22 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1055  hypothetical protein  24 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  29.95 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  23.86 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  30.69 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1246  hypothetical protein  24.04 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0325  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.83 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.486164 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  43.04 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  32.02 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  25 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1445  hypothetical protein  23.08 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428238  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  35.51 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  28.5 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  30.1 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1223  hypothetical protein  23.08 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  29.41 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1486  hypothetical protein  23.08 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  22.5 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  31.36 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3961  hypothetical protein  23.08 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  40 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1383  hypothetical protein  23.08 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  29.73 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>