More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1788 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.68 
 
 
207 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.81 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.33 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.29 
 
 
227 aa  164  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.17 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  44.92 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.09 
 
 
204 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.94 
 
 
208 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.33 
 
 
206 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  43.55 
 
 
204 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.43 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.43 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.8 
 
 
213 aa  153  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.11 
 
 
205 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.86 
 
 
208 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.86 
 
 
208 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.58 
 
 
205 aa  148  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.16 
 
 
206 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.2 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.05 
 
 
222 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.05 
 
 
222 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  41.05 
 
 
222 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.84 
 
 
205 aa  141  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.2 
 
 
208 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.86 
 
 
204 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  34.52 
 
 
207 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.42 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  32.16 
 
 
206 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.16 
 
 
195 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.63 
 
 
204 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.98 
 
 
206 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.63 
 
 
204 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  35.98 
 
 
206 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.59 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  30.57 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.1 
 
 
215 aa  92  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.03 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.96 
 
 
212 aa  89  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.96 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.03 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.49 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.49 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.49 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.49 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.49 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.49 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.49 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.49 
 
 
212 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.15 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.26 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  27.49 
 
 
559 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.8 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  31.25 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  25.95 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  27.46 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  26.32 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  29.23 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4442  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.55 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4728  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.64 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.900627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.55 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.792036  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4759  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.55 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4669  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.55 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  28.72 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  26.5 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  23.86 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  28.35 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  30.57 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3795  class II aldolase/adducin family protein  28.42 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.114454  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4806  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.42 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4656  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.42 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3815  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.04 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0563678 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04027  hypothetical protein  26.53 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04065  L-ribulose 5-phosphate 4-epimerase  26.53 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  30.11 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0125  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.81 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  28.49 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  30.99 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0147  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.81 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.14 
 
 
226 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  27.14 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  33.01 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  32.18 
 
 
229 aa  62  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3955  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.58 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.918987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0053  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.77 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3891  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.58 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4000  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.58 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.850049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  30.22 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  30.22 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  26.46 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4062  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.58 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.612579 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1019  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.08 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  40.19 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1072  class II aldolase/adducin family protein  37.74 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3538  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.81 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0063  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.81 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0142427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0065  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.81 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4427  class II aldolase/adducin family protein  27.07 
 
 
266 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3596  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.81 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000129105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>