More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0907 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
208 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  63.27 
 
 
208 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  62.94 
 
 
205 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  62.44 
 
 
205 aa  255  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  63.27 
 
 
204 aa  254  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  63.73 
 
 
204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  60 
 
 
206 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  55.45 
 
 
207 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  52.91 
 
 
213 aa  214  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  51.47 
 
 
227 aa  207  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  53.81 
 
 
208 aa  204  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  53.81 
 
 
208 aa  204  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.95 
 
 
222 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.95 
 
 
222 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49.51 
 
 
218 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49.03 
 
 
218 aa  191  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.42 
 
 
222 aa  191  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.17 
 
 
206 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.89 
 
 
205 aa  185  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  49.47 
 
 
204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.08 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  48.42 
 
 
205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  47.37 
 
 
205 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  39.29 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.64 
 
 
204 aa  174  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.5 
 
 
213 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  45.63 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.92 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  40.8 
 
 
207 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  38.33 
 
 
206 aa  131  9e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.64 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.64 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.98 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.9 
 
 
195 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.02 
 
 
215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  31.75 
 
 
207 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.08 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  36.36 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.36 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.89 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.16 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 
212 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.99 
 
 
212 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 
212 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 
212 aa  101  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 
212 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 
212 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 
212 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.18 
 
 
212 aa  101  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 
212 aa  101  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 
212 aa  101  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.34 
 
 
212 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.18 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.79 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  30.88 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  27.88 
 
 
559 aa  82  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  31.72 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  28.49 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  27.03 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  30.17 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  31.44 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  31.22 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  29.95 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  35.42 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  26.9 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  25.25 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  28.49 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89976  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234213  decreased coverage  0.00849343 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  28.57 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  30.16 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0426  class II aldolase/adducin family protein  26.34 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000249785  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1072  class II aldolase/adducin family protein  29.73 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  27.96 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2736  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.65 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2898  class II aldolase/adducin family protein  28.37 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.38221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3467  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.62 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.443237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  36.27 
 
 
385 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  40.38 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3815  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.77 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0563678 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  33.67 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3795  class II aldolase/adducin family protein  26.77 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.114454  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0481  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.78 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4759  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.77 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  26.92 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04065  L-ribulose 5-phosphate 4-epimerase  26.77 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04027  hypothetical protein  26.77 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4442  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.77 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.77 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.792036  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.87 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  35.51 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4728  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.87 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.900627  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3395  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.97 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3262  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.97 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0923  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.97 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.809116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  38.14 
 
 
212 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1810  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.19 
 
 
238 aa  62  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00111407  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1319  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.39 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4806  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.09 
 
 
228 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4669  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.26 
 
 
228 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>