More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0307 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  72.91 
 
 		 204 aa  318  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  72.91 
 
 		 204 aa  318  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  50.24 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.24 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.96 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.53 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.67 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.91 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.52 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.33 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.39 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.92 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.84 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.07 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.11 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.17 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.98 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  34.39 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  33.16 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.8 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.86 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.39 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.17 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.39 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.39 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.39 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.86 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.27 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.68 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.68 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.81 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.68 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.68 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.68 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.68 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.68 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.68 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.16 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.91 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.96 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.91 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.28 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.28 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.96 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.22 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  28.64 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  28.64 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.35 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  27.46 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.75 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.5 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  28.5 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.44 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  29.53 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  30.19 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  37.89 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  29.65 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  29.65 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  29.65 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  29.65 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  29.65 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  29.65 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  29.65 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  40.43 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.04 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  38.3 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  29.9 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  30.1 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  37.23 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  37.23 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  37.23 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  37.23 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  37.23 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  35.48 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89976  conserved hypothetical protein  26.27 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234213  decreased coverage  0.00849343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  28.71 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  27.23 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  28.57 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  28.65 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  28.14 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  27.57 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  28.92 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  25.79 
 
 		 428 aa  65.1  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  27.57 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  27.27 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  25.33 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  30.97 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  26.67 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  28.68 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  28 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  29 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  27.87 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  27.87 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  27.87 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  27.87 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  25.84 
 
 		 239 aa  62  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  28 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  32.71 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>