126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02290 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
244 aa  511  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  54.73 
 
 
240 aa  228  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89976  conserved hypothetical protein  48.95 
 
 
265 aa  219  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234213  decreased coverage  0.00849343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  50.68 
 
 
226 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  47.71 
 
 
252 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  42.06 
 
 
559 aa  173  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.96 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  24.66 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  27.69 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.68 
 
 
215 aa  72  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  28.31 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.17 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.86 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.7 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.17 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.36 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.86 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.17 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.89 
 
 
204 aa  67  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.17 
 
 
204 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.17 
 
 
204 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  27.96 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.36 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.36 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.04 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.36 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.71 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.41 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.57 
 
 
195 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.53 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.5 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.94 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.94 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.94 
 
 
212 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.94 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.94 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.94 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.53 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.94 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.47 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.25 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.07 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.88 
 
 
210 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.11 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.48 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  25 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  22.73 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  24.88 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.11 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  24.88 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  30 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.83 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.83 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1319  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.7 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.96 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0481  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.5 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0325  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.01 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  27.27 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  38.89 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  26.36 
 
 
398 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.42 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.42 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  24.88 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  26.02 
 
 
234 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0470  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.3 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.39 
 
 
206 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  28.7 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2239  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.63 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.391403  normal  0.0542739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2021  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.63 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.919407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1529  class II aldolase/adducin family protein  24.88 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599207  normal  0.531556 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.64 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  25.45 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1910  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.63 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00106894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3262  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.47 
 
 
231 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  25.12 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0923  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.47 
 
 
231 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.809116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3395  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.47 
 
 
231 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  25.73 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  24.88 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  24.27 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  27.36 
 
 
213 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  33.94 
 
 
212 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  29.1 
 
 
214 aa  45.4  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  27.43 
 
 
216 aa  45.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  25.62 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  33.03 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1992  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.84 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00598433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  25.66 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  25.66 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3939  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.91 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.850936 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  25.66 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.65 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  25.66 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  28.48 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  27.09 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1706  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.52 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0268969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>