More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1845 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  56.44 
 
 
207 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  57.14 
 
 
195 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  53.06 
 
 
206 aa  209  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.32 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.57 
 
 
205 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.78 
 
 
222 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.78 
 
 
222 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  40 
 
 
207 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.61 
 
 
213 aa  135  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.02 
 
 
205 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.78 
 
 
222 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  39.69 
 
 
218 aa  134  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.09 
 
 
205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.57 
 
 
205 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  37.84 
 
 
208 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  39.58 
 
 
218 aa  131  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.39 
 
 
204 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40.88 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.48 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.57 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  39.47 
 
 
208 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  39.47 
 
 
208 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  37.5 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.88 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.93 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.5 
 
 
204 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.99 
 
 
203 aa  124  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.38 
 
 
216 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.35 
 
 
210 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.35 
 
 
213 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  34.47 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.47 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.83 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.93 
 
 
215 aa  111  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.98 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.16 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.22 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.63 
 
 
212 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.63 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.16 
 
 
206 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.63 
 
 
212 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.63 
 
 
212 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.83 
 
 
208 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.63 
 
 
212 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.63 
 
 
212 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.63 
 
 
212 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.63 
 
 
212 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.63 
 
 
212 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  32.31 
 
 
252 aa  91.3  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.29 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.29 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.8 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.36 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.96 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  27.78 
 
 
244 aa  74.7  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  27.83 
 
 
559 aa  74.7  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89976  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 
265 aa  72  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234213  decreased coverage  0.00849343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1383  hypothetical protein  23.44 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3961  hypothetical protein  23.44 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  29.38 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  30.1 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0773  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.14 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000354298  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2736  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.37 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1055  hypothetical protein  23.24 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1445  hypothetical protein  22.92 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1223  hypothetical protein  22.92 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0648  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.06 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1221  hypothetical protein  22.4 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00266219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1420  hypothetical protein  22.4 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2139  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.75 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  normal  0.896628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  26.73 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0325  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.65 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1246  hypothetical protein  22.92 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1319  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.42 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  27 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4669  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.56 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  28.36 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0823  class II aldolase/adducin family protein  33.12 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.345059  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  29.95 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  26.7 
 
 
240 aa  64.7  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4728  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.04 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.900627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1810  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.89 
 
 
238 aa  64.7  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00111407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2067  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.32 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000421715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1486  hypothetical protein  22.4 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  27.01 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04065  L-ribulose 5-phosphate 4-epimerase  26.04 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  24.26 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3815  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.04 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0563678 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3795  class II aldolase/adducin family protein  26.04 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.114454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4442  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.04 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04027  hypothetical protein  26.04 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  27.36 
 
 
234 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  27.23 
 
 
237 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.04 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.792036  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  26.04 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4759  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.04 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1736  class II aldolase/adducin family protein  27.1 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1996  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.8 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000658884  unclonable  0.0000198726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>