172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0986 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  100 
 
 		 206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.2 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  42.7 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  43.09 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.14 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.29 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.17 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.71 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.64 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.71 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.71 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.17 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.71 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.71 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.71 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.71 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.71 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.14 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  38.73 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  36.07 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  33.69 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.84 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.38 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  39.43 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.63 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  37.63 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  39.11 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.97 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.95 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.49 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.26 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.26 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.9 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  37.82 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.26 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.26 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.49 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.9 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.32 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  32.84 
 
 		 252 aa  94.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.82 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.43 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.82 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  34.43 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  34.97 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  33.17 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.08 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.51 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.08 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.19 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.71 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  40 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  36.98 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  28.57 
 
 		 559 aa  81.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.71 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1055  hypothetical protein  27.53 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  29.89 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1383  hypothetical protein  25.99 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3961  hypothetical protein  25.99 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.23 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1223  hypothetical protein  26.11 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1445  hypothetical protein  26.11 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1486  hypothetical protein  26.11 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1246  hypothetical protein  26.11 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1221  hypothetical protein  25.56 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00266219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1420  hypothetical protein  25.56 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306976 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5230  L-fuculose-phosphate aldolase  35.59 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  26.73 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  32.14 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  26.32 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89976  conserved hypothetical protein  24 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234213  decreased coverage  0.00849343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  32.34 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  27.93 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  32.97 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  31.38 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  31.16 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1247  hypothetical protein  25.78 
 
 		 136 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  29.8 
 
 		 753 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  30.56 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  28.33 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  30.17 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  29.71 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  31.79 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  31.79 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  33.53 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  35.15 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  35.15 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3995  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.02 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0420304  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  35.15 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  28.19 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1236  class II aldolase/adducin family protein  25.87 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0903016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  30.98 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  28.57 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  30.54 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  31.18 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  30.85 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  31.52 
 
 		 235 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2362  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.04 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0354866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  28.65 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>