107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89976 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_89976  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  553  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234213  decreased coverage  0.00849343 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  54.51 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  48.95 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  44.98 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  39.23 
 
 		 559 aa  167  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  39.29 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.38 
 
 		 211 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.13 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  25.33 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.34 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.48 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.48 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  25.24 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.96 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.91 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.77 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.51 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.29 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.68 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.51 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  25.11 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.7 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.27 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.66 
 
 		 203 aa  67  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27.71 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.88 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.38 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.89 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.89 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.55 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.55 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.89 
 
 		 222 aa  62  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  23.87 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.77 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.23 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  25.22 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  24.78 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  25.12 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  25.33 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.46 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  26.96 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.67 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.67 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  23.91 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0648  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  24.23 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  24.11 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.34 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  22.22 
 
 		 206 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  25.45 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  25.54 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  26.89 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  24.43 
 
 		 190 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1319  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.23 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  23.26 
 
 		 180 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1055  hypothetical protein  34.57 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  29.27 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  22.42 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  24.28 
 
 		 398 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  21.12 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  21.12 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  31.82 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  29.31 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  23.58 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1221  hypothetical protein  34.18 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00266219  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  25 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1383  hypothetical protein  34.18 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3961  hypothetical protein  34.18 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1420  hypothetical protein  34.18 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1445  hypothetical protein  34.18 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1486  hypothetical protein  34.18 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  26.51 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  22.46 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1223  hypothetical protein  32.91 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  30.77 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  29.52 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  22.57 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  19.11 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  21.96 
 
 		 181 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1246  hypothetical protein  31.65 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  22.52 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  23.85 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  28.93 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  27.78 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  23.35 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0481  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.79 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.17 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  23.53 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  23.5 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  28.93 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0470  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.46 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  22.71 
 
 		 214 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>