160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4305 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4305  class II aldolase/adducin-like  100 
 
 
252 aa  529  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00261955  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4248  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  54.37 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02290  cytoplasm protein, putative  47.71 
 
 
244 aa  194  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03593  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12840)  47.22 
 
 
240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.931983 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  43.4 
 
 
559 aa  165  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89976  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 
265 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234213  decreased coverage  0.00849343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1845  putative sugar aldolase  33.15 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1993  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.69 
 
 
206 aa  89  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.5622 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.61 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1782  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00848  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 
208 aa  86.3  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06079  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.81 
 
 
208 aa  86.3  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  35.2 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.5 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0490  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.85 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0907  class II aldolase/adducin family protein  30.88 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1268  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.99 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2045  class II aldolase/adducin domain protein  30.3 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0362341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1855  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.3 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123422  normal  0.880882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21771  putative sugar aldolase  29.32 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1747  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.68 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3589  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.63 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0098  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.41 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.23 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2737  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0029503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0885  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.25 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3867  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.79505  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0918  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.46 
 
 
205 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4169  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4105  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3948  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3795  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4257  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42740  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.47 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0307  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.19 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4147  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4059  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1724  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.71 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1091  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0942  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.7 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1852  class II aldolase/adducin family protein  29.47 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.604682  normal  0.0869346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0598  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.17 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.635649  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0436  aldolase, class II  29.17 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23780  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.61 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.63 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.63 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.63 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1410  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.57 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.238632  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1343  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.57 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3457  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.63 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0852  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  27 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.08 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1788  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  26.32 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00210025  normal  0.0224188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2510  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  31.16 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0986  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  30.61 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1603  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.5 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.648125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1578  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.5 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  26.32 
 
 
216 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  22.22 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  32.35 
 
 
214 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  25.94 
 
 
264 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0017  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.87 
 
 
213 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  36.27 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  34 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
215 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1415  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  29.15 
 
 
208 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  28.3 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  27.4 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  33.65 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  32.32 
 
 
217 aa  52.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.37 
 
 
214 aa  52  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1529  class II aldolase/adducin family protein  29.41 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599207  normal  0.531556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  33.01 
 
 
228 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  21.76 
 
 
180 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  33.66 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  33.66 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  28.07 
 
 
214 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  26.29 
 
 
188 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  29.91 
 
 
215 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  34.02 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  29.91 
 
 
215 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  25.36 
 
 
398 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  29.91 
 
 
215 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  29.91 
 
 
215 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  29.91 
 
 
215 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  29.91 
 
 
215 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  29.52 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  30.21 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  28.44 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  28.97 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  28.97 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  27.14 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  28.97 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  28.97 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  27.54 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  21.33 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  30.91 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1385  L-fuculose phosphate aldolase  25.13 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.190215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>