222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5734 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5734  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 		 351 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2069  L-threonine aldolase  52.84 
 
 		 379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0009  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  54.49 
 
 		 352 aa  305  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.49 
 
 		 345 aa  285  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5453  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.4 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  48.22 
 
 		 353 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  42.01 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  44.08 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  44.08 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  50.89 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  46.11 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  46.73 
 
 		 357 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  41.12 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  43.75 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  45.24 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  45.24 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  48.05 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.34 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  46.59 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  45.64 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  41.64 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  44.06 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  41.92 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  43.25 
 
 		 344 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  43.24 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  43.84 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  42.35 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  44.83 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  36.9 
 
 		 343 aa  222  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  39.58 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  46.61 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  38.05 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  42.35 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  40.79 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  38.53 
 
 		 344 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  44.97 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.2 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  45.37 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  41.76 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  38.53 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  45.03 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  35.91 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  45.93 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6894  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.61 
 
 		 339 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  41.47 
 
 		 337 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  44.44 
 
 		 349 aa  215  8e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  43.71 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  44.81 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.99 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  38.46 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  44.81 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  44.81 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.88 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.64 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  42.94 
 
 		 334 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.64 
 
 		 347 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  43.21 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  46.88 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  43.21 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  42.31 
 
 		 343 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  43.21 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  43.21 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  43.21 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  38.64 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  40.76 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  36.75 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  44.05 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  43.57 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  36.55 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  44.44 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  45.99 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  40.97 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  40.79 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  36.98 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  44.38 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  45.51 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2609  Threonine aldolase  43.67 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270764  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  41.54 
 
 		 348 aa  205  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  40.29 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2851  L-threonine aldolase  45.06 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  42.01 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  42.01 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  42.01 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  41.79 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  42.01 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  44.28 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  40.18 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  39.71 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  43.29 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  39.59 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  39.64 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  41.94 
 
 		 339 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3700  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.37 
 
 		 355 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  40 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  39.24 
 
 		 333 aa  202  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  39.7 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  42.01 
 
 		 397 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  39.35 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  42.01 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  42.01 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>