More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3700 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3700  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 		 355 aa  716    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  83.94 
 
 		 360 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1764  threonine aldolase  88.7 
 
 		 388 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382651  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5390  putative L-allo-threonine aldolase  79.44 
 
 		 355 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.891866  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1602  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  69.3 
 
 		 371 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2609  Threonine aldolase  67.05 
 
 		 366 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  62.9 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  49.12 
 
 		 343 aa  329  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50 
 
 		 347 aa  318  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5192  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50 
 
 		 348 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.56 
 
 		 344 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  48.06 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  45.82 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  46.97 
 
 		 340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  46.85 
 
 		 461 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  46.31 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  46.31 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_002978  WD0618  L-allo-threonine aldolase, putative  41.4 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  41.3 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  41.3 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  46.25 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  46.25 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  46.25 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  46.25 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  46.25 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  46.25 
 
 		 397 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  46.48 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  46.25 
 
 		 458 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  45.83 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  45.95 
 
 		 337 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  44.77 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  46.48 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  46.48 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  47.66 
 
 		 343 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  46.18 
 
 		 337 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  43.79 
 
 		 353 aa  245  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  38.69 
 
 		 343 aa  242  9e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  41.4 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  43.03 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.12 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  43.7 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  42.82 
 
 		 355 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  46.06 
 
 		 339 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  44.64 
 
 		 339 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  47.01 
 
 		 335 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  43.81 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  39.41 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  45.81 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  40.48 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  38.46 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  40.54 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  43.96 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  43.33 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.85 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  43.92 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  46.73 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  43.2 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  43.2 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  41.52 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  44.01 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  45.06 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  42.9 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  37.57 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  41.11 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  41.46 
 
 		 370 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  42.43 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  43.86 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  43.81 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  42.52 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  42.6 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  40.82 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  44.58 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  43.81 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  43.81 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  38.17 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  43.5 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  43.81 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  43.24 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  40.61 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  41.47 
 
 		 338 aa  222  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  42.77 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  42.03 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  42.94 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  42.94 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  42.94 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  42.94 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  42.94 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  42.94 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  42.64 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  42.94 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  41.41 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  40.41 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  42.48 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  37.04 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  44 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  41.72 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  42.48 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  44.07 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  39.41 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>