293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1602 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1602  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 		 371 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1764  threonine aldolase  71.67 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382651  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  66.2 
 
 		 360 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5390  putative L-allo-threonine aldolase  70.54 
 
 		 355 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.891866  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2609  Threonine aldolase  68.27 
 
 		 366 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270764  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3700  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  69.3 
 
 		 355 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  61.71 
 
 		 352 aa  428  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  49.12 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  52.28 
 
 		 347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.98 
 
 		 347 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5192  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.76 
 
 		 348 aa  319  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0618  L-allo-threonine aldolase, putative  43.15 
 
 		 350 aa  287  2.9999999999999996e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  48.25 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.83 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.35 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  44.87 
 
 		 340 aa  256  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  42.57 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  40 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  43.45 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  42.41 
 
 		 349 aa  250  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  44.44 
 
 		 461 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  43.1 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  40.66 
 
 		 343 aa  247  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  40.66 
 
 		 343 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  39.94 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  43.41 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  42.69 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  42.69 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  43.54 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  43.54 
 
 		 337 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  43.54 
 
 		 337 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  43.54 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  43.54 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  43.54 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  43.54 
 
 		 458 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  43.07 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  42.73 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  42.73 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  39.88 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  38.02 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  42.81 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  42.81 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  43.2 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  42.82 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  42.81 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  41.74 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  38.11 
 
 		 344 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  40.81 
 
 		 370 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  40.18 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  44.74 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  36.39 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  43.84 
 
 		 335 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  42.18 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  41.94 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  40.35 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  39.59 
 
 		 339 aa  225  8e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  43.69 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  40.84 
 
 		 338 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  38.87 
 
 		 344 aa  223  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  42.27 
 
 		 352 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  37.94 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  40.48 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  35.52 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  40.84 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  40.84 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  40.18 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  40.87 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  38.53 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  39.41 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.82 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  40.18 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  40.18 
 
 		 333 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  40.18 
 
 		 333 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  40.18 
 
 		 333 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  40.18 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  40.18 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  37.8 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  43.15 
 
 		 339 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  40.18 
 
 		 333 aa  219  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  43.79 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  35.33 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  42.34 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  40.87 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  42.34 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  38.53 
 
 		 343 aa  215  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  39.53 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.14 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  40.54 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  40.18 
 
 		 333 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  40.54 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  40.12 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  39.18 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  38.19 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  39.58 
 
 		 333 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  39.88 
 
 		 333 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  39.88 
 
 		 333 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  39.88 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  44.27 
 
 		 331 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  41.41 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  39.94 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>