208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4499 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  100 
 
 
348 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  55.26 
 
 
357 aa  358  7e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  55.36 
 
 
359 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  51.16 
 
 
344 aa  335  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  52.63 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  49.12 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  46.8 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  46.8 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  47.41 
 
 
344 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  48.65 
 
 
353 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  50.58 
 
 
386 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  50.58 
 
 
356 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  50.58 
 
 
386 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  45.77 
 
 
353 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  45.8 
 
 
344 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  50 
 
 
348 aa  288  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  49.71 
 
 
339 aa  285  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.02 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  49.12 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  46.36 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  44.84 
 
 
366 aa  282  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  45.91 
 
 
343 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  47.94 
 
 
334 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  44.44 
 
 
334 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  44.86 
 
 
338 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  43.9 
 
 
337 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  46.02 
 
 
337 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  50 
 
 
339 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  45.72 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  43.73 
 
 
341 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  44.67 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  45.69 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  45.14 
 
 
339 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  44.87 
 
 
337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  44.94 
 
 
337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.96 
 
 
339 aa  268  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  45.14 
 
 
339 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  44.87 
 
 
337 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  45.18 
 
 
333 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  44.64 
 
 
333 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  44.86 
 
 
351 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  45.29 
 
 
333 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  44.98 
 
 
333 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  45.29 
 
 
333 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  44.98 
 
 
333 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  44.98 
 
 
333 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  44.68 
 
 
333 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  44.68 
 
 
333 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  44.84 
 
 
337 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  46.4 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  40.7 
 
 
343 aa  263  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  47.44 
 
 
333 aa  262  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  43.82 
 
 
337 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.76 
 
 
344 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  45.03 
 
 
333 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  43.82 
 
 
337 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  43.82 
 
 
337 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  45.03 
 
 
333 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  43.82 
 
 
337 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  48.51 
 
 
340 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  45.03 
 
 
333 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  45.03 
 
 
333 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  45.03 
 
 
333 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  43.82 
 
 
336 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  46.92 
 
 
337 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  45.45 
 
 
461 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  41.28 
 
 
343 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  46.18 
 
 
337 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  45.48 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  45.29 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  42.03 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  44.35 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  44.35 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  44.61 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  46.18 
 
 
334 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  45.45 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  45.45 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  45.45 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  45.45 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  45.45 
 
 
458 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  45.45 
 
 
397 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  45.45 
 
 
397 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  45.29 
 
 
337 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  46.4 
 
 
342 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  44.71 
 
 
337 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  45.03 
 
 
349 aa  249  7e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  44.57 
 
 
356 aa  249  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  44.41 
 
 
337 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  43.7 
 
 
368 aa  248  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  41.09 
 
 
336 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  42.15 
 
 
336 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  46.02 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  46.02 
 
 
335 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  46.49 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.03 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  45.06 
 
 
337 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  42.54 
 
 
355 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  42.74 
 
 
354 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  40.94 
 
 
359 aa  238  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  44.74 
 
 
345 aa  238  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>