More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0162 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  100 
 
 
343 aa  711    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  56.07 
 
 
345 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  55.59 
 
 
343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  55.59 
 
 
343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  48.13 
 
 
344 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  47.23 
 
 
341 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  46.96 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  46.38 
 
 
359 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  46.09 
 
 
353 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  49.7 
 
 
343 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  44.48 
 
 
344 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  45.13 
 
 
334 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  44.54 
 
 
334 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  42.27 
 
 
357 aa  293  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  43.95 
 
 
359 aa  288  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  43.66 
 
 
343 aa  288  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  43.24 
 
 
337 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  43.49 
 
 
337 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  42.94 
 
 
337 aa  279  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  43.44 
 
 
338 aa  278  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  43.98 
 
 
366 aa  278  8e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  43.2 
 
 
337 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  41.81 
 
 
338 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  42.94 
 
 
337 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.56 
 
 
348 aa  276  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  43.53 
 
 
337 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  42.9 
 
 
337 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  43.79 
 
 
336 aa  276  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  42.9 
 
 
337 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  42.94 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  43.86 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  42.11 
 
 
339 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  44.71 
 
 
336 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  41.06 
 
 
333 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  43.31 
 
 
337 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  41.64 
 
 
339 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  42.52 
 
 
348 aa  269  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  43.31 
 
 
339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  40.99 
 
 
339 aa  269  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  40.47 
 
 
333 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  40.88 
 
 
333 aa  268  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  40.88 
 
 
333 aa  268  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  41.76 
 
 
351 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  40.88 
 
 
333 aa  268  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  43.54 
 
 
344 aa  268  8e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  40.88 
 
 
333 aa  268  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  40.47 
 
 
333 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  40.88 
 
 
333 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  40.47 
 
 
333 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  40.88 
 
 
333 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  40.59 
 
 
333 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  40.47 
 
 
333 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  40.18 
 
 
333 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  42.94 
 
 
336 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  40.59 
 
 
333 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  42.94 
 
 
344 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  40.59 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.64 
 
 
344 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  43.07 
 
 
335 aa  265  8e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  42.23 
 
 
338 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  40.06 
 
 
337 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  40.7 
 
 
348 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  42.22 
 
 
340 aa  261  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  41.06 
 
 
334 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  40.64 
 
 
338 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  36.98 
 
 
343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  42.82 
 
 
343 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  40.29 
 
 
337 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  41.76 
 
 
337 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.82 
 
 
339 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  42.65 
 
 
336 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  41.06 
 
 
334 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  42.4 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  36.36 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  41.35 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  42.68 
 
 
339 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  45.06 
 
 
345 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  39.18 
 
 
342 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  41.12 
 
 
356 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  41.12 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  41.12 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  39.3 
 
 
338 aa  250  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  41.64 
 
 
342 aa  248  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  42.73 
 
 
367 aa  245  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  41.57 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  37.83 
 
 
352 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  37.29 
 
 
356 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  41.45 
 
 
334 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  38.17 
 
 
359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2851  L-threonine aldolase  42.09 
 
 
343 aa  239  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  41.16 
 
 
334 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0009  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.82 
 
 
352 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  38.08 
 
 
368 aa  235  6e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  37.01 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  35.48 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  42.37 
 
 
343 aa  232  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  35.74 
 
 
340 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  38.4 
 
 
355 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  39.65 
 
 
461 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  38.69 
 
 
344 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>