253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2367 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  100 
 
 
359 aa  739    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.78 
 
 
345 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  50.44 
 
 
343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  50.44 
 
 
343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  49.41 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  49.28 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  50.29 
 
 
345 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  48.24 
 
 
353 aa  315  8e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  46.47 
 
 
343 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  46.31 
 
 
343 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  48.36 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  48.66 
 
 
337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  49.55 
 
 
339 aa  302  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  47.08 
 
 
338 aa  301  9e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  48.96 
 
 
338 aa  298  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  46.04 
 
 
359 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  46.31 
 
 
349 aa  295  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.46 
 
 
348 aa  294  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  47.35 
 
 
343 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.61 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  43.95 
 
 
343 aa  288  9e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  44.6 
 
 
357 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  43.36 
 
 
338 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  48.93 
 
 
348 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  45.1 
 
 
348 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  44.84 
 
 
353 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  47.08 
 
 
359 aa  275  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  47.75 
 
 
340 aa  275  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  43.4 
 
 
340 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  43.03 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  44.87 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  44.41 
 
 
343 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  44.84 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  44.54 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  44.17 
 
 
339 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  44.51 
 
 
344 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  44.21 
 
 
344 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  47.08 
 
 
339 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  45.88 
 
 
339 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  45.09 
 
 
339 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  44.13 
 
 
351 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  43.53 
 
 
338 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.49 
 
 
339 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  45.09 
 
 
339 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  41.67 
 
 
340 aa  258  8e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  44.65 
 
 
333 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  42.48 
 
 
334 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  44.82 
 
 
336 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  41.94 
 
 
343 aa  255  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  44.82 
 
 
333 aa  255  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  44.11 
 
 
343 aa  255  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  43.24 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  44.65 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  44.65 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  44.65 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  43.24 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  44.65 
 
 
333 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  42.94 
 
 
337 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  42.48 
 
 
337 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  44.34 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  44.34 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  42.94 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  44.65 
 
 
333 aa  252  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  42.48 
 
 
337 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  45 
 
 
337 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  42.77 
 
 
337 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  41.27 
 
 
366 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  42.48 
 
 
337 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  43.73 
 
 
333 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  41.86 
 
 
348 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  41.59 
 
 
337 aa  248  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.48 
 
 
347 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  42.51 
 
 
337 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  44.07 
 
 
338 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  43.43 
 
 
333 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  43.43 
 
 
333 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  43.43 
 
 
333 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  43.12 
 
 
333 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  43.58 
 
 
334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  43.29 
 
 
337 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  44.11 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  44.74 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  43.07 
 
 
336 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  44.04 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  43.58 
 
 
334 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.29 
 
 
347 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5192  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.58 
 
 
348 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.82 
 
 
352 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  40.83 
 
 
355 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  40.94 
 
 
348 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  44.41 
 
 
336 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  41.23 
 
 
342 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6894  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.9 
 
 
339 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  41.74 
 
 
386 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  45.14 
 
 
352 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  41.86 
 
 
356 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  41.74 
 
 
386 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  42 
 
 
461 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  46.63 
 
 
334 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  45.85 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>