258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0105 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  100 
 
 
344 aa  703    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  54.03 
 
 
345 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  52.79 
 
 
343 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  52.79 
 
 
343 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  52.48 
 
 
357 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  50.59 
 
 
341 aa  349  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  54.73 
 
 
353 aa  347  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  50.15 
 
 
353 aa  344  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  48.13 
 
 
343 aa  333  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.32 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  50.3 
 
 
343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  51.01 
 
 
359 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  53.15 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  50.6 
 
 
344 aa  318  9e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  48.27 
 
 
344 aa  317  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  48.82 
 
 
344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.39 
 
 
348 aa  308  8e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  49.1 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  48.36 
 
 
359 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  51.93 
 
 
339 aa  305  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  47.09 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  46.61 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  47.49 
 
 
334 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  48.36 
 
 
337 aa  301  8.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  49.7 
 
 
349 aa  301  9e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  45.8 
 
 
348 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  45.07 
 
 
366 aa  291  8e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  43.9 
 
 
349 aa  291  9e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  44.48 
 
 
343 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  45.48 
 
 
338 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  45.66 
 
 
337 aa  288  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  47.11 
 
 
333 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  47.67 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  45.77 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  49.28 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  48.94 
 
 
334 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  47.67 
 
 
339 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  45.38 
 
 
337 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  47.11 
 
 
333 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  47.11 
 
 
333 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  45.53 
 
 
337 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  47.11 
 
 
333 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  46.81 
 
 
333 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  47.66 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  47.38 
 
 
351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  47.31 
 
 
344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  45.53 
 
 
337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  46.06 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  46.06 
 
 
333 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  46.06 
 
 
333 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  46.06 
 
 
333 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  46.06 
 
 
333 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  46.06 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  47.08 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  46.06 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  46.06 
 
 
333 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  48.94 
 
 
334 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  46.5 
 
 
359 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  45.78 
 
 
337 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.85 
 
 
339 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  46.18 
 
 
333 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  48.96 
 
 
338 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  44.44 
 
 
333 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  45.48 
 
 
337 aa  279  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  41.94 
 
 
340 aa  276  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  48.1 
 
 
343 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  46.33 
 
 
337 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  46.33 
 
 
337 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  44.41 
 
 
342 aa  275  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  45.88 
 
 
337 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  46.33 
 
 
337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  44.35 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  48.38 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  45.37 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  45.75 
 
 
343 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  44.28 
 
 
337 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  44.48 
 
 
343 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  46.5 
 
 
348 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  46.09 
 
 
335 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  47.59 
 
 
386 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  47.59 
 
 
386 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  47.59 
 
 
356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  46.53 
 
 
334 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  40.23 
 
 
338 aa  267  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  45.06 
 
 
461 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  45.48 
 
 
338 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  47.23 
 
 
361 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  45.92 
 
 
342 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  44.28 
 
 
339 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  44.35 
 
 
356 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  44.09 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  43.82 
 
 
352 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  43.64 
 
 
336 aa  259  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  43.99 
 
 
397 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  44.12 
 
 
337 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  44.12 
 
 
337 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  48.98 
 
 
337 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  43.99 
 
 
397 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  42.2 
 
 
340 aa  258  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  44.12 
 
 
337 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>