More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0449 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  100 
 
 
343 aa  699    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  58.67 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  58.67 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  56.01 
 
 
345 aa  378  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  50.3 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  49.71 
 
 
353 aa  324  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  49.11 
 
 
341 aa  322  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  50.6 
 
 
344 aa  317  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  50.6 
 
 
344 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.79 
 
 
344 aa  316  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  46.47 
 
 
359 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  49.7 
 
 
343 aa  311  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  48.81 
 
 
353 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  50.15 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  45.4 
 
 
344 aa  299  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  47.81 
 
 
343 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  47.89 
 
 
357 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  43.18 
 
 
338 aa  295  5e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  45.1 
 
 
342 aa  295  9e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.58 
 
 
348 aa  295  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  46.18 
 
 
338 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  46.2 
 
 
334 aa  292  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.55 
 
 
339 aa  291  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  44.67 
 
 
337 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  45.05 
 
 
339 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  48.64 
 
 
339 aa  288  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  45.45 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  43.45 
 
 
340 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  45.59 
 
 
343 aa  285  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  47.62 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  42.15 
 
 
349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  46.33 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  46.36 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  46.06 
 
 
351 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  45.4 
 
 
349 aa  280  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  45.78 
 
 
348 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  46.06 
 
 
339 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  43.49 
 
 
343 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  45.87 
 
 
333 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  45.82 
 
 
359 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  45.57 
 
 
333 aa  275  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  45.57 
 
 
333 aa  275  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  45.57 
 
 
333 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  45.57 
 
 
333 aa  275  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  46.13 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  45.26 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  45.26 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  43.92 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  45.15 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  44.95 
 
 
333 aa  272  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  43.99 
 
 
333 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5734  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.01 
 
 
351 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  45.67 
 
 
345 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  44.18 
 
 
337 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  44.08 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0009  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.52 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  42.4 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  43.62 
 
 
337 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  44.08 
 
 
337 aa  269  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  45.77 
 
 
334 aa  269  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  44.65 
 
 
333 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  42.77 
 
 
344 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  44.89 
 
 
336 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  44.65 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  44.65 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  44.65 
 
 
333 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  44.34 
 
 
333 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  44.18 
 
 
337 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  45.02 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  46.08 
 
 
339 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  44.51 
 
 
337 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  44.51 
 
 
337 aa  265  8e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  42.4 
 
 
337 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2069  L-threonine aldolase  43.03 
 
 
379 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  41.1 
 
 
340 aa  262  6e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  43.15 
 
 
337 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  42.86 
 
 
337 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  44.71 
 
 
338 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  44.11 
 
 
334 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  42.17 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  42.56 
 
 
337 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  41.28 
 
 
348 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  40.6 
 
 
348 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  42.82 
 
 
356 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  43.59 
 
 
352 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  42.82 
 
 
386 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  42.82 
 
 
386 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  44.21 
 
 
461 aa  255  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  44.94 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  44.94 
 
 
397 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  43.47 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  45.07 
 
 
337 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  44.94 
 
 
397 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  45.07 
 
 
337 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  45.07 
 
 
337 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  45.07 
 
 
337 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  43.03 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  41.02 
 
 
368 aa  251  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  41.25 
 
 
331 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  42.73 
 
 
337 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>