222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2053 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  100 
 
 
349 aa  697    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  65.41 
 
 
348 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  59.16 
 
 
337 aa  373  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  49.7 
 
 
344 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  46.31 
 
 
359 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.28 
 
 
345 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  45.29 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  45.29 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  45.4 
 
 
343 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  48.52 
 
 
339 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  43.86 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  45.93 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.65 
 
 
339 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  42.04 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  52.02 
 
 
343 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.94 
 
 
344 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  49.27 
 
 
340 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  45.91 
 
 
339 aa  259  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  47.13 
 
 
334 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  46.22 
 
 
334 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  43.35 
 
 
344 aa  252  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  44.35 
 
 
357 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  44.64 
 
 
344 aa  252  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  42.11 
 
 
340 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  45.22 
 
 
348 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  42.98 
 
 
344 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  47.04 
 
 
338 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  41.19 
 
 
344 aa  249  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  45.03 
 
 
348 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  43.71 
 
 
337 aa  249  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  42.23 
 
 
338 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  46.4 
 
 
359 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  45.54 
 
 
337 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  44.14 
 
 
349 aa  245  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  44.74 
 
 
353 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  44.13 
 
 
352 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  46.87 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  42.86 
 
 
337 aa  245  9e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  45.24 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  41 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  44.31 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  46.44 
 
 
342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  44.94 
 
 
337 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  46.13 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  46.13 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  46.13 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  46.13 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  42.9 
 
 
343 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  46.13 
 
 
397 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  44.94 
 
 
337 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  46.13 
 
 
397 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  44.64 
 
 
337 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  46.13 
 
 
458 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  43.15 
 
 
359 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  47.21 
 
 
339 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  45.54 
 
 
461 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  43.84 
 
 
370 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  41.45 
 
 
334 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  51.24 
 
 
345 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  44.05 
 
 
337 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  43.73 
 
 
343 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  44.05 
 
 
337 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  46.38 
 
 
331 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  44.71 
 
 
355 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  44.17 
 
 
333 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  46.55 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  45.95 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0009  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.75 
 
 
352 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  40.12 
 
 
340 aa  235  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6894  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.88 
 
 
339 aa  235  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  45.02 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  37.76 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  47.15 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  43.83 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  43.52 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  43.52 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  43.52 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  43.21 
 
 
333 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  45.07 
 
 
348 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  42.51 
 
 
339 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  46.8 
 
 
361 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  42.51 
 
 
339 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  45.07 
 
 
366 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  46.55 
 
 
334 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  42.2 
 
 
368 aa  229  5e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  42.22 
 
 
351 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  44.05 
 
 
334 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.23 
 
 
360 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  45.95 
 
 
335 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  42.64 
 
 
337 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  41.9 
 
 
333 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  42.52 
 
 
337 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  42.28 
 
 
333 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  42.34 
 
 
337 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  42.04 
 
 
337 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  42.82 
 
 
336 aa  227  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  42.52 
 
 
337 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  42.52 
 
 
337 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  47.02 
 
 
367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  41.98 
 
 
333 aa  225  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>